Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJL0

Smarcal1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcal1Q8BJL0 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smarcal1Q8BJL0 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smarcal1Q8BJL0 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smarcal1Q8BJL0 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smarcal1Q8BJL0 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smarcal1Q8BJL0 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smarcal1Q8BJL0 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smarcal1Q8BJL0 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smarcal1Q8BJL0 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smarcal1Q8BJL0 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smarcal1Q8BJL0 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smarcal1Q8BJL0 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smarcal1Q8BJL0 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Smarcal1Q8BJL0 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Smarcal1Q8BJL0 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Smarcal1Q8BJL0 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Smarcal1Q8BJL0 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Smarcal1Q8BJL0 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Smarcal1Q8BJL0 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Smarcal1Q8BJL0 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smarcal1Q8BJL0 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smarcal1Q8BJL0 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smarcal1Q8BJL0 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smarcal1Q8BJL0 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smarcal1Q8BJL0 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smarcal1Q8BJL0 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smarcal1Q8BJL0 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smarcal1Q8BJL0 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smarcal1Q8BJL0 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smarcal1Q8BJL0 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smarcal1Q8BJL0 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smarcal1Q8BJL0 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smarcal1Q8BJL0 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smarcal1Q8BJL0 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smarcal1Q8BJL0 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smarcal1Q8BJL0 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smarcal1Q8BJL0 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smarcal1Q8BJL0 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smarcal1Q8BJL0 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smarcal1Q8BJL0 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smarcal1Q8BJL0 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smarcal1Q8BJL0 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smarcal1Q8BJL0 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smarcal1Q8BJL0 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smarcal1Q8BJL0 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smarcal1Q8BJL0 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smarcal1Q8BJL0 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smarcal1Q8BJL0 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smarcal1Q8BJL0 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smarcal1Q8BJL0 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smarcal1Q8BJL0 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smarcal1Q8BJL0 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smarcal1Q8BJL0 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smarcal1Q8BJL0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smarcal1Q8BJL0 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smarcal1Q8BJL0 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smarcal1Q8BJL0 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smarcal1Q8BJL0 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smarcal1Q8BJL0 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smarcal1Q8BJL0 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smarcal1Q8BJL0 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smarcal1Q8BJL0 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smarcal1Q8BJL0 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smarcal1Q8BJL0 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smarcal1Q8BJL0 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smarcal1Q8BJL0 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smarcal1Q8BJL0 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smarcal1Q8BJL0 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smarcal1Q8BJL0 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smarcal1Q8BJL0 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smarcal1Q8BJL0 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smarcal1Q8BJL0 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smarcal1Q8BJL0 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smarcal1Q8BJL0 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smarcal1Q8BJL0 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smarcal1Q8BJL0 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smarcal1Q8BJL0 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smarcal1Q8BJL0 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smarcal1Q8BJL0 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smarcal1Q8BJL0 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smarcal1Q8BJL0 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smarcal1Q8BJL0 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smarcal1Q8BJL0 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smarcal1Q8BJL0 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smarcal1Q8BJL0 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smarcal1Q8BJL0 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smarcal1Q8BJL0 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Smarcal1Q8BJL0 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smarcal1Q8BJL0 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smarcal1Q8BJL0 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smarcal1Q8BJL0 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smarcal1Q8BJL0 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smarcal1Q8BJL0 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smarcal1Q8BJL0 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smarcal1Q8BJL0 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smarcal1Q8BJL0 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smarcal1Q8BJL0 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Smarcal1Q8BJL0 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smarcal1Q8BJL0 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smarcal1Q8BJL0 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms