Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHX3

Cdca8, Borealin, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca8Q8BHX3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdca8Q8BHX3 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdca8Q8BHX3 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdca8Q8BHX3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdca8Q8BHX3 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdca8Q8BHX3 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdca8Q8BHX3 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdca8Q8BHX3 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdca8Q8BHX3 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdca8Q8BHX3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdca8Q8BHX3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdca8Q8BHX3 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdca8Q8BHX3 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdca8Q8BHX3 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdca8Q8BHX3 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdca8Q8BHX3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdca8Q8BHX3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdca8Q8BHX3 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdca8Q8BHX3 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdca8Q8BHX3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdca8Q8BHX3 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdca8Q8BHX3 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdca8Q8BHX3 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdca8Q8BHX3 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdca8Q8BHX3 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdca8Q8BHX3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdca8Q8BHX3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdca8Q8BHX3 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdca8Q8BHX3 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdca8Q8BHX3 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdca8Q8BHX3 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdca8Q8BHX3 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdca8Q8BHX3 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdca8Q8BHX3 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdca8Q8BHX3 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdca8Q8BHX3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdca8Q8BHX3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdca8Q8BHX3 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdca8Q8BHX3 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdca8Q8BHX3 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdca8Q8BHX3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdca8Q8BHX3 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdca8Q8BHX3 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdca8Q8BHX3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdca8Q8BHX3 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdca8Q8BHX3 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdca8Q8BHX3 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdca8Q8BHX3 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdca8Q8BHX3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdca8Q8BHX3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdca8Q8BHX3 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdca8Q8BHX3 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdca8Q8BHX3 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdca8Q8BHX3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdca8Q8BHX3 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdca8Q8BHX3 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdca8Q8BHX3 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdca8Q8BHX3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdca8Q8BHX3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cdca8Q8BHX3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cdca8Q8BHX3 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdca8Q8BHX3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdca8Q8BHX3 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdca8Q8BHX3 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdca8Q8BHX3 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdca8Q8BHX3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdca8Q8BHX3 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdca8Q8BHX3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdca8Q8BHX3 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdca8Q8BHX3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdca8Q8BHX3 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdca8Q8BHX3 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdca8Q8BHX3 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdca8Q8BHX3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdca8Q8BHX3 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdca8Q8BHX3 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdca8Q8BHX3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdca8Q8BHX3 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdca8Q8BHX3 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdca8Q8BHX3 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdca8Q8BHX3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdca8Q8BHX3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdca8Q8BHX3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdca8Q8BHX3 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdca8Q8BHX3 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdca8Q8BHX3 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdca8Q8BHX3 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdca8Q8BHX3 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdca8Q8BHX3 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdca8Q8BHX3 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdca8Q8BHX3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdca8Q8BHX3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdca8Q8BHX3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdca8Q8BHX3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdca8Q8BHX3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdca8Q8BHX3 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdca8Q8BHX3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdca8Q8BHX3 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdca8Q8BHX3 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdca8Q8BHX3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms