Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg4dQ8BGV9 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg4dQ8BGV9 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg4dQ8BGV9 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg4dQ8BGV9 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg4dQ8BGV9 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg4dQ8BGV9 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg4dQ8BGV9 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg4dQ8BGV9 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg4dQ8BGV9 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg4dQ8BGV9 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg4dQ8BGV9 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg4dQ8BGV9 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg4dQ8BGV9 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg4dQ8BGV9 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg4dQ8BGV9 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg4dQ8BGV9 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg4dQ8BGV9 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg4dQ8BGV9 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg4dQ8BGV9 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg4dQ8BGV9 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg4dQ8BGV9 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg4dQ8BGV9 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg4dQ8BGV9 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg4dQ8BGV9 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg4dQ8BGV9 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg4dQ8BGV9 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg4dQ8BGV9 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg4dQ8BGV9 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg4dQ8BGV9 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg4dQ8BGV9 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg4dQ8BGV9 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg4dQ8BGV9 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg4dQ8BGV9 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg4dQ8BGV9 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg4dQ8BGV9 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg4dQ8BGV9 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg4dQ8BGV9 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg4dQ8BGV9 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg4dQ8BGV9 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg4dQ8BGV9 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg4dQ8BGV9 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg4dQ8BGV9 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg4dQ8BGV9 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg4dQ8BGV9 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg4dQ8BGV9 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg4dQ8BGV9 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg4dQ8BGV9 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg4dQ8BGV9 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg4dQ8BGV9 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg4dQ8BGV9 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg4dQ8BGV9 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg4dQ8BGV9 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg4dQ8BGV9 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg4dQ8BGV9 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg4dQ8BGV9 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg4dQ8BGV9 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg4dQ8BGV9 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atg4dQ8BGV9 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atg4dQ8BGV9 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atg4dQ8BGV9 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atg4dQ8BGV9 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atg4dQ8BGV9 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Atg4dQ8BGV9 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Atg4dQ8BGV9 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atg4dQ8BGV9 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Atg4dQ8BGV9 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Atg4dQ8BGV9 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Atg4dQ8BGV9 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Atg4dQ8BGV9 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Atg4dQ8BGV9 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg4dQ8BGV9 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg4dQ8BGV9 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg4dQ8BGV9 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg4dQ8BGV9 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg4dQ8BGV9 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg4dQ8BGV9 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg4dQ8BGV9 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg4dQ8BGV9 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg4dQ8BGV9 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg4dQ8BGV9 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg4dQ8BGV9 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg4dQ8BGV9 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg4dQ8BGV9 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg4dQ8BGV9 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg4dQ8BGV9 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg4dQ8BGV9 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg4dQ8BGV9 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg4dQ8BGV9 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg4dQ8BGV9 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg4dQ8BGV9 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg4dQ8BGV9 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg4dQ8BGV9 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg4dQ8BGV9 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg4dQ8BGV9 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg4dQ8BGV9 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg4dQ8BGV9 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg4dQ8BGV9 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg4dQ8BGV9 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg4dQ8BGV9 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms