Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGP6

Slc25a40, Solute carrier family 25 member 40, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc25a40Q8BGP6 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc25a40Q8BGP6 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc25a40Q8BGP6 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc25a40Q8BGP6 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc25a40Q8BGP6 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc25a40Q8BGP6 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc25a40Q8BGP6 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc25a40Q8BGP6 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc25a40Q8BGP6 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc25a40Q8BGP6 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc25a40Q8BGP6 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc25a40Q8BGP6 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc25a40Q8BGP6 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc25a40Q8BGP6 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc25a40Q8BGP6 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc25a40Q8BGP6 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc25a40Q8BGP6 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc25a40Q8BGP6 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc25a40Q8BGP6 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc25a40Q8BGP6 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc25a40Q8BGP6 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc25a40Q8BGP6 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc25a40Q8BGP6 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc25a40Q8BGP6 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc25a40Q8BGP6 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc25a40Q8BGP6 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc25a40Q8BGP6 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc25a40Q8BGP6 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc25a40Q8BGP6 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc25a40Q8BGP6 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc25a40Q8BGP6 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc25a40Q8BGP6 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc25a40Q8BGP6 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc25a40Q8BGP6 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc25a40Q8BGP6 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc25a40Q8BGP6 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc25a40Q8BGP6 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc25a40Q8BGP6 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc25a40Q8BGP6 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc25a40Q8BGP6 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc25a40Q8BGP6 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc25a40Q8BGP6 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc25a40Q8BGP6 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc25a40Q8BGP6 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc25a40Q8BGP6 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc25a40Q8BGP6 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc25a40Q8BGP6 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc25a40Q8BGP6 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc25a40Q8BGP6 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc25a40Q8BGP6 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc25a40Q8BGP6 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc25a40Q8BGP6 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc25a40Q8BGP6 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc25a40Q8BGP6 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc25a40Q8BGP6 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc25a40Q8BGP6 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc25a40Q8BGP6 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc25a40Q8BGP6 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc25a40Q8BGP6 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc25a40Q8BGP6 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc25a40Q8BGP6 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc25a40Q8BGP6 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc25a40Q8BGP6 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc25a40Q8BGP6 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc25a40Q8BGP6 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc25a40Q8BGP6 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc25a40Q8BGP6 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc25a40Q8BGP6 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc25a40Q8BGP6 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc25a40Q8BGP6 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc25a40Q8BGP6 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc25a40Q8BGP6 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc25a40Q8BGP6 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc25a40Q8BGP6 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc25a40Q8BGP6 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc25a40Q8BGP6 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc25a40Q8BGP6 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc25a40Q8BGP6 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc25a40Q8BGP6 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc25a40Q8BGP6 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc25a40Q8BGP6 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc25a40Q8BGP6 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc25a40Q8BGP6 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc25a40Q8BGP6 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc25a40Q8BGP6 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc25a40Q8BGP6 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Slc25a40Q8BGP6 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Slc25a40Q8BGP6 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Slc25a40Q8BGP6 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc25a40Q8BGP6 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc25a40Q8BGP6 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc25a40Q8BGP6 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc25a40Q8BGP6 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc25a40Q8BGP6 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc25a40Q8BGP6 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc25a40Q8BGP6 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc25a40Q8BGP6 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc25a40Q8BGP6 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc25a40Q8BGP6 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc25a40Q8BGP6 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms