Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

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Length 757 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Htatsf1Q8BGC0 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Htatsf1Q8BGC0 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Htatsf1Q8BGC0 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Htatsf1Q8BGC0 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Htatsf1Q8BGC0 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Htatsf1Q8BGC0 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Htatsf1Q8BGC0 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Htatsf1Q8BGC0 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Htatsf1Q8BGC0 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Htatsf1Q8BGC0 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Htatsf1Q8BGC0 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Htatsf1Q8BGC0 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Htatsf1Q8BGC0 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Htatsf1Q8BGC0 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Htatsf1Q8BGC0 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Htatsf1Q8BGC0 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Htatsf1Q8BGC0 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Htatsf1Q8BGC0 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Htatsf1Q8BGC0 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Htatsf1Q8BGC0 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Htatsf1Q8BGC0 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Htatsf1Q8BGC0 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Htatsf1Q8BGC0 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Htatsf1Q8BGC0 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Htatsf1Q8BGC0 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Htatsf1Q8BGC0 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Htatsf1Q8BGC0 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Htatsf1Q8BGC0 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Htatsf1Q8BGC0 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Htatsf1Q8BGC0 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Htatsf1Q8BGC0 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Htatsf1Q8BGC0 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Htatsf1Q8BGC0 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Htatsf1Q8BGC0 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Htatsf1Q8BGC0 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Htatsf1Q8BGC0 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Htatsf1Q8BGC0 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Htatsf1Q8BGC0 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Htatsf1Q8BGC0 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Htatsf1Q8BGC0 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Htatsf1Q8BGC0 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Htatsf1Q8BGC0 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Htatsf1Q8BGC0 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Htatsf1Q8BGC0 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Htatsf1Q8BGC0 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Htatsf1Q8BGC0 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Htatsf1Q8BGC0 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Htatsf1Q8BGC0 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Htatsf1Q8BGC0 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Htatsf1Q8BGC0 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Htatsf1Q8BGC0 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Htatsf1Q8BGC0 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Htatsf1Q8BGC0 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Htatsf1Q8BGC0 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Htatsf1Q8BGC0 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Htatsf1Q8BGC0 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Htatsf1Q8BGC0 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Htatsf1Q8BGC0 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Htatsf1Q8BGC0 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Htatsf1Q8BGC0 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Htatsf1Q8BGC0 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
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Htatsf1Q8BGC0 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Htatsf1Q8BGC0 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
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Htatsf1Q8BGC0 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
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Htatsf1Q8BGC0 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Htatsf1Q8BGC0 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Htatsf1Q8BGC0 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Htatsf1Q8BGC0 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Htatsf1Q8BGC0 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Htatsf1Q8BGC0 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Htatsf1Q8BGC0 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Htatsf1Q8BGC0 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Htatsf1Q8BGC0 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Htatsf1Q8BGC0 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Htatsf1Q8BGC0 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Htatsf1Q8BGC0 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Htatsf1Q8BGC0 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Htatsf1Q8BGC0 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Htatsf1Q8BGC0 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Htatsf1Q8BGC0 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Htatsf1Q8BGC0 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Htatsf1Q8BGC0 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Htatsf1Q8BGC0 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Htatsf1Q8BGC0 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Htatsf1Q8BGC0 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Htatsf1Q8BGC0 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Htatsf1Q8BGC0 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Htatsf1Q8BGC0 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Htatsf1Q8BGC0 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Htatsf1Q8BGC0 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Htatsf1Q8BGC0 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Htatsf1Q8BGC0 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Htatsf1Q8BGC0 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Htatsf1Q8BGC0 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Htatsf1Q8BGC0 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms