Protein–RNA interactions for Protein: Q811C2

Atg4c, Cysteine protease ATG4C, mousemouse

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Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4cQ811C2 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atg4cQ811C2 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Atg4cQ811C2 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atg4cQ811C2 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atg4cQ811C2 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Atg4cQ811C2 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atg4cQ811C2 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Atg4cQ811C2 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atg4cQ811C2 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atg4cQ811C2 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atg4cQ811C2 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atg4cQ811C2 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atg4cQ811C2 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atg4cQ811C2 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atg4cQ811C2 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atg4cQ811C2 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atg4cQ811C2 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atg4cQ811C2 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atg4cQ811C2 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atg4cQ811C2 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Atg4cQ811C2 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Atg4cQ811C2 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Atg4cQ811C2 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Atg4cQ811C2 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Atg4cQ811C2 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Atg4cQ811C2 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Atg4cQ811C2 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Atg4cQ811C2 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Atg4cQ811C2 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Atg4cQ811C2 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Atg4cQ811C2 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Atg4cQ811C2 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Atg4cQ811C2 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Atg4cQ811C2 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Atg4cQ811C2 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Atg4cQ811C2 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Atg4cQ811C2 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Atg4cQ811C2 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Atg4cQ811C2 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Atg4cQ811C2 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Atg4cQ811C2 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Atg4cQ811C2 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Atg4cQ811C2 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Atg4cQ811C2 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Atg4cQ811C2 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Atg4cQ811C2 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Atg4cQ811C2 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Atg4cQ811C2 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Atg4cQ811C2 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Atg4cQ811C2 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Atg4cQ811C2 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Atg4cQ811C2 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Atg4cQ811C2 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Atg4cQ811C2 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Atg4cQ811C2 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Atg4cQ811C2 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Atg4cQ811C2 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Atg4cQ811C2 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Atg4cQ811C2 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Atg4cQ811C2 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Atg4cQ811C2 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Atg4cQ811C2 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Atg4cQ811C2 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Atg4cQ811C2 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Atg4cQ811C2 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Atg4cQ811C2 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Atg4cQ811C2 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Atg4cQ811C2 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Atg4cQ811C2 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Atg4cQ811C2 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Atg4cQ811C2 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Atg4cQ811C2 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Atg4cQ811C2 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Atg4cQ811C2 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Atg4cQ811C2 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Atg4cQ811C2 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Atg4cQ811C2 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Atg4cQ811C2 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Atg4cQ811C2 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Atg4cQ811C2 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Atg4cQ811C2 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Atg4cQ811C2 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Atg4cQ811C2 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Atg4cQ811C2 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Atg4cQ811C2 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Atg4cQ811C2 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Atg4cQ811C2 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Atg4cQ811C2 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Atg4cQ811C2 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Atg4cQ811C2 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Atg4cQ811C2 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Atg4cQ811C2 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Atg4cQ811C2 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Atg4cQ811C2 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Atg4cQ811C2 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Atg4cQ811C2 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Atg4cQ811C2 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Atg4cQ811C2 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Atg4cQ811C2 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Atg4cQ811C2 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
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