Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc50Q810U5 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc50Q810U5 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc50Q810U5 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc50Q810U5 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc50Q810U5 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc50Q810U5 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc50Q810U5 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc50Q810U5 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc50Q810U5 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc50Q810U5 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc50Q810U5 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc50Q810U5 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc50Q810U5 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc50Q810U5 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc50Q810U5 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc50Q810U5 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc50Q810U5 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc50Q810U5 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc50Q810U5 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc50Q810U5 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc50Q810U5 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ccdc50Q810U5 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc50Q810U5 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc50Q810U5 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc50Q810U5 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc50Q810U5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc50Q810U5 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc50Q810U5 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc50Q810U5 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc50Q810U5 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc50Q810U5 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc50Q810U5 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc50Q810U5 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc50Q810U5 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc50Q810U5 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc50Q810U5 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc50Q810U5 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc50Q810U5 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc50Q810U5 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc50Q810U5 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc50Q810U5 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc50Q810U5 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc50Q810U5 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc50Q810U5 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc50Q810U5 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc50Q810U5 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc50Q810U5 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc50Q810U5 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc50Q810U5 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc50Q810U5 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc50Q810U5 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc50Q810U5 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc50Q810U5 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc50Q810U5 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc50Q810U5 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc50Q810U5 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc50Q810U5 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc50Q810U5 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc50Q810U5 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc50Q810U5 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc50Q810U5 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc50Q810U5 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc50Q810U5 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc50Q810U5 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc50Q810U5 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc50Q810U5 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc50Q810U5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc50Q810U5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc50Q810U5 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc50Q810U5 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc50Q810U5 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc50Q810U5 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc50Q810U5 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc50Q810U5 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc50Q810U5 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc50Q810U5 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc50Q810U5 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc50Q810U5 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc50Q810U5 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc50Q810U5 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc50Q810U5 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc50Q810U5 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc50Q810U5 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc50Q810U5 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc50Q810U5 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc50Q810U5 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc50Q810U5 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc50Q810U5 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc50Q810U5 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc50Q810U5 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc50Q810U5 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc50Q810U5 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc50Q810U5 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc50Q810U5 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc50Q810U5 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc50Q810U5 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc50Q810U5 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc50Q810U5 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc50Q810U5 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms