Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc172Q810N9 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc172Q810N9 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc172Q810N9 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc172Q810N9 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc172Q810N9 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc172Q810N9 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc172Q810N9 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc172Q810N9 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc172Q810N9 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc172Q810N9 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc172Q810N9 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc172Q810N9 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc172Q810N9 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc172Q810N9 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc172Q810N9 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc172Q810N9 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc172Q810N9 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc172Q810N9 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc172Q810N9 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc172Q810N9 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc172Q810N9 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc172Q810N9 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc172Q810N9 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc172Q810N9 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc172Q810N9 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc172Q810N9 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc172Q810N9 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc172Q810N9 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc172Q810N9 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc172Q810N9 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc172Q810N9 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc172Q810N9 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc172Q810N9 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc172Q810N9 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc172Q810N9 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc172Q810N9 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc172Q810N9 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc172Q810N9 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc172Q810N9 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc172Q810N9 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc172Q810N9 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc172Q810N9 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc172Q810N9 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc172Q810N9 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc172Q810N9 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc172Q810N9 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc172Q810N9 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc172Q810N9 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc172Q810N9 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc172Q810N9 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc172Q810N9 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc172Q810N9 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc172Q810N9 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc172Q810N9 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc172Q810N9 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc172Q810N9 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc172Q810N9 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc172Q810N9 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc172Q810N9 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc172Q810N9 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc172Q810N9 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc172Q810N9 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc172Q810N9 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc172Q810N9 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc172Q810N9 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc172Q810N9 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc172Q810N9 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc172Q810N9 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc172Q810N9 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc172Q810N9 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc172Q810N9 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc172Q810N9 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc172Q810N9 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc172Q810N9 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc172Q810N9 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc172Q810N9 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc172Q810N9 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc172Q810N9 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc172Q810N9 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc172Q810N9 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc172Q810N9 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc172Q810N9 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc172Q810N9 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc172Q810N9 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc172Q810N9 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc172Q810N9 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc172Q810N9 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc172Q810N9 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc172Q810N9 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc172Q810N9 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc172Q810N9 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc172Q810N9 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc172Q810N9 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc172Q810N9 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc172Q810N9 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc172Q810N9 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc172Q810N9 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc172Q810N9 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc172Q810N9 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms