Protein–RNA interactions for Protein: Q810L4

Tmem39b, Transmembrane protein 39B, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem39bQ810L4 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmem39bQ810L4 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmem39bQ810L4 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmem39bQ810L4 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmem39bQ810L4 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmem39bQ810L4 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmem39bQ810L4 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmem39bQ810L4 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmem39bQ810L4 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmem39bQ810L4 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmem39bQ810L4 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmem39bQ810L4 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmem39bQ810L4 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmem39bQ810L4 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmem39bQ810L4 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmem39bQ810L4 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmem39bQ810L4 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmem39bQ810L4 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmem39bQ810L4 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmem39bQ810L4 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmem39bQ810L4 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmem39bQ810L4 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmem39bQ810L4 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmem39bQ810L4 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmem39bQ810L4 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmem39bQ810L4 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmem39bQ810L4 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmem39bQ810L4 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmem39bQ810L4 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmem39bQ810L4 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmem39bQ810L4 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmem39bQ810L4 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmem39bQ810L4 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmem39bQ810L4 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmem39bQ810L4 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmem39bQ810L4 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmem39bQ810L4 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmem39bQ810L4 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmem39bQ810L4 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmem39bQ810L4 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmem39bQ810L4 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmem39bQ810L4 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmem39bQ810L4 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmem39bQ810L4 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmem39bQ810L4 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmem39bQ810L4 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmem39bQ810L4 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmem39bQ810L4 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmem39bQ810L4 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmem39bQ810L4 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmem39bQ810L4 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmem39bQ810L4 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmem39bQ810L4 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmem39bQ810L4 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmem39bQ810L4 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmem39bQ810L4 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmem39bQ810L4 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmem39bQ810L4 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmem39bQ810L4 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmem39bQ810L4 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmem39bQ810L4 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmem39bQ810L4 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmem39bQ810L4 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmem39bQ810L4 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmem39bQ810L4 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmem39bQ810L4 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmem39bQ810L4 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmem39bQ810L4 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmem39bQ810L4 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmem39bQ810L4 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmem39bQ810L4 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmem39bQ810L4 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmem39bQ810L4 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmem39bQ810L4 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmem39bQ810L4 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmem39bQ810L4 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmem39bQ810L4 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmem39bQ810L4 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmem39bQ810L4 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmem39bQ810L4 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmem39bQ810L4 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmem39bQ810L4 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmem39bQ810L4 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmem39bQ810L4 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmem39bQ810L4 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmem39bQ810L4 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmem39bQ810L4 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmem39bQ810L4 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmem39bQ810L4 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmem39bQ810L4 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmem39bQ810L4 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmem39bQ810L4 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmem39bQ810L4 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmem39bQ810L4 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmem39bQ810L4 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmem39bQ810L4 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmem39bQ810L4 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmem39bQ810L4 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmem39bQ810L4 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmem39bQ810L4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms