Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y84

Kdm5b, Lysine-specific demethylase 5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5bQ80Y84 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Kdm5bQ80Y84 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Kdm5bQ80Y84 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Kdm5bQ80Y84 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Kdm5bQ80Y84 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Kdm5bQ80Y84 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Kdm5bQ80Y84 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Kdm5bQ80Y84 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Kdm5bQ80Y84 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Kdm5bQ80Y84 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Kdm5bQ80Y84 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Kdm5bQ80Y84 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Kdm5bQ80Y84 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Kdm5bQ80Y84 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Kdm5bQ80Y84 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Kdm5bQ80Y84 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Kdm5bQ80Y84 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Kdm5bQ80Y84 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Kdm5bQ80Y84 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Kdm5bQ80Y84 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Kdm5bQ80Y84 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Kdm5bQ80Y84 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Kdm5bQ80Y84 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Kdm5bQ80Y84 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Kdm5bQ80Y84 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Kdm5bQ80Y84 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Kdm5bQ80Y84 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Kdm5bQ80Y84 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Kdm5bQ80Y84 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Kdm5bQ80Y84 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Kdm5bQ80Y84 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Kdm5bQ80Y84 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Kdm5bQ80Y84 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Kdm5bQ80Y84 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Kdm5bQ80Y84 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Kdm5bQ80Y84 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Kdm5bQ80Y84 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Kdm5bQ80Y84 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Kdm5bQ80Y84 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Kdm5bQ80Y84 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Kdm5bQ80Y84 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Kdm5bQ80Y84 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Kdm5bQ80Y84 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Kdm5bQ80Y84 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Kdm5bQ80Y84 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Kdm5bQ80Y84 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Kdm5bQ80Y84 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Kdm5bQ80Y84 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Kdm5bQ80Y84 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Kdm5bQ80Y84 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Kdm5bQ80Y84 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Kdm5bQ80Y84 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Kdm5bQ80Y84 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Kdm5bQ80Y84 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Kdm5bQ80Y84 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Kdm5bQ80Y84 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Kdm5bQ80Y84 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Kdm5bQ80Y84 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Kdm5bQ80Y84 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Kdm5bQ80Y84 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Kdm5bQ80Y84 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Kdm5bQ80Y84 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Kdm5bQ80Y84 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Kdm5bQ80Y84 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Kdm5bQ80Y84 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Kdm5bQ80Y84 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Kdm5bQ80Y84 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Kdm5bQ80Y84 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Kdm5bQ80Y84 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Kdm5bQ80Y84 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Kdm5bQ80Y84 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Kdm5bQ80Y84 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Kdm5bQ80Y84 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Kdm5bQ80Y84 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Kdm5bQ80Y84 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Kdm5bQ80Y84 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Kdm5bQ80Y84 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Kdm5bQ80Y84 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Kdm5bQ80Y84 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Kdm5bQ80Y84 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Kdm5bQ80Y84 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Kdm5bQ80Y84 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Kdm5bQ80Y84 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Kdm5bQ80Y84 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Kdm5bQ80Y84 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Kdm5bQ80Y84 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Kdm5bQ80Y84 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Kdm5bQ80Y84 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Kdm5bQ80Y84 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Kdm5bQ80Y84 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Kdm5bQ80Y84 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Kdm5bQ80Y84 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Kdm5bQ80Y84 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Kdm5bQ80Y84 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Kdm5bQ80Y84 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Kdm5bQ80Y84 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Kdm5bQ80Y84 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Kdm5bQ80Y84 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Kdm5bQ80Y84 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Kdm5bQ80Y84 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.5 ms