Protein–RNA interactions for Protein: Q80XK6

Atg2b, Autophagy-related protein 2 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 2,075 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2bQ80XK6 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atg2bQ80XK6 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atg2bQ80XK6 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atg2bQ80XK6 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atg2bQ80XK6 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atg2bQ80XK6 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atg2bQ80XK6 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atg2bQ80XK6 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atg2bQ80XK6 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atg2bQ80XK6 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Atg2bQ80XK6 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atg2bQ80XK6 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Atg2bQ80XK6 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atg2bQ80XK6 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atg2bQ80XK6 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Atg2bQ80XK6 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Atg2bQ80XK6 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atg2bQ80XK6 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg2bQ80XK6 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg2bQ80XK6 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg2bQ80XK6 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg2bQ80XK6 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg2bQ80XK6 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg2bQ80XK6 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg2bQ80XK6 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Atg2bQ80XK6 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg2bQ80XK6 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg2bQ80XK6 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg2bQ80XK6 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Atg2bQ80XK6 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg2bQ80XK6 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg2bQ80XK6 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg2bQ80XK6 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atg2bQ80XK6 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atg2bQ80XK6 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Atg2bQ80XK6 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Atg2bQ80XK6 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Atg2bQ80XK6 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atg2bQ80XK6 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atg2bQ80XK6 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Atg2bQ80XK6 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atg2bQ80XK6 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atg2bQ80XK6 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg2bQ80XK6 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg2bQ80XK6 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg2bQ80XK6 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg2bQ80XK6 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg2bQ80XK6 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg2bQ80XK6 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg2bQ80XK6 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg2bQ80XK6 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg2bQ80XK6 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg2bQ80XK6 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg2bQ80XK6 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg2bQ80XK6 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg2bQ80XK6 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg2bQ80XK6 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg2bQ80XK6 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg2bQ80XK6 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg2bQ80XK6 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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