Protein–RNA interactions for Protein: Q80U93

Nup214, Nuclear pore complex protein Nup214, mousemouse

Predictions only

Length 2,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup214Q80U93 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup214Q80U93 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup214Q80U93 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup214Q80U93 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup214Q80U93 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup214Q80U93 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup214Q80U93 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup214Q80U93 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup214Q80U93 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup214Q80U93 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup214Q80U93 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup214Q80U93 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup214Q80U93 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup214Q80U93 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup214Q80U93 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup214Q80U93 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup214Q80U93 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup214Q80U93 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup214Q80U93 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup214Q80U93 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup214Q80U93 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup214Q80U93 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup214Q80U93 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup214Q80U93 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup214Q80U93 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup214Q80U93 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup214Q80U93 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup214Q80U93 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup214Q80U93 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup214Q80U93 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup214Q80U93 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup214Q80U93 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup214Q80U93 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup214Q80U93 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup214Q80U93 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup214Q80U93 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup214Q80U93 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup214Q80U93 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup214Q80U93 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup214Q80U93 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup214Q80U93 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup214Q80U93 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup214Q80U93 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup214Q80U93 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup214Q80U93 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup214Q80U93 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup214Q80U93 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup214Q80U93 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup214Q80U93 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup214Q80U93 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup214Q80U93 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup214Q80U93 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup214Q80U93 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup214Q80U93 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup214Q80U93 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup214Q80U93 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup214Q80U93 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup214Q80U93 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup214Q80U93 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup214Q80U93 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup214Q80U93 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup214Q80U93 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup214Q80U93 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup214Q80U93 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup214Q80U93 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup214Q80U93 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup214Q80U93 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup214Q80U93 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup214Q80U93 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup214Q80U93 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup214Q80U93 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup214Q80U93 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup214Q80U93 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup214Q80U93 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup214Q80U93 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup214Q80U93 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup214Q80U93 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup214Q80U93 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup214Q80U93 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup214Q80U93 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup214Q80U93 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup214Q80U93 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup214Q80U93 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup214Q80U93 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup214Q80U93 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup214Q80U93 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup214Q80U93 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup214Q80U93 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup214Q80U93 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup214Q80U93 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup214Q80U93 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup214Q80U93 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup214Q80U93 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup214Q80U93 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup214Q80U93 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup214Q80U93 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup214Q80U93 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup214Q80U93 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup214Q80U93 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup214Q80U93 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms