Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT50

Cdc42bpb, Serine/threonine-protein kinase MRCK beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42bpbQ7TT50 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Cdc42bpbQ7TT50 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Cdc42bpbQ7TT50 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cdc42bpbQ7TT50 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cdc42bpbQ7TT50 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cdc42bpbQ7TT50 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cdc42bpbQ7TT50 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cdc42bpbQ7TT50 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cdc42bpbQ7TT50 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cdc42bpbQ7TT50 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cdc42bpbQ7TT50 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cdc42bpbQ7TT50 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cdc42bpbQ7TT50 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cdc42bpbQ7TT50 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cdc42bpbQ7TT50 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cdc42bpbQ7TT50 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cdc42bpbQ7TT50 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cdc42bpbQ7TT50 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cdc42bpbQ7TT50 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cdc42bpbQ7TT50 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cdc42bpbQ7TT50 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cdc42bpbQ7TT50 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cdc42bpbQ7TT50 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cdc42bpbQ7TT50 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cdc42bpbQ7TT50 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cdc42bpbQ7TT50 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cdc42bpbQ7TT50 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cdc42bpbQ7TT50 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cdc42bpbQ7TT50 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cdc42bpbQ7TT50 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cdc42bpbQ7TT50 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cdc42bpbQ7TT50 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cdc42bpbQ7TT50 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cdc42bpbQ7TT50 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cdc42bpbQ7TT50 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cdc42bpbQ7TT50 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cdc42bpbQ7TT50 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cdc42bpbQ7TT50 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cdc42bpbQ7TT50 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cdc42bpbQ7TT50 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cdc42bpbQ7TT50 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.64
Cdc42bpbQ7TT50 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cdc42bpbQ7TT50 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cdc42bpbQ7TT50 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cdc42bpbQ7TT50 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cdc42bpbQ7TT50 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cdc42bpbQ7TT50 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Cdc42bpbQ7TT50 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cdc42bpbQ7TT50 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cdc42bpbQ7TT50 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cdc42bpbQ7TT50 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cdc42bpbQ7TT50 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Cdc42bpbQ7TT50 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cdc42bpbQ7TT50 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Cdc42bpbQ7TT50 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cdc42bpbQ7TT50 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cdc42bpbQ7TT50 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cdc42bpbQ7TT50 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cdc42bpbQ7TT50 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cdc42bpbQ7TT50 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cdc42bpbQ7TT50 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cdc42bpbQ7TT50 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cdc42bpbQ7TT50 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cdc42bpbQ7TT50 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Cdc42bpbQ7TT50 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Cdc42bpbQ7TT50 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cdc42bpbQ7TT50 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cdc42bpbQ7TT50 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cdc42bpbQ7TT50 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cdc42bpbQ7TT50 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cdc42bpbQ7TT50 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cdc42bpbQ7TT50 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Cdc42bpbQ7TT50 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cdc42bpbQ7TT50 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cdc42bpbQ7TT50 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cdc42bpbQ7TT50 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cdc42bpbQ7TT50 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cdc42bpbQ7TT50 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cdc42bpbQ7TT50 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cdc42bpbQ7TT50 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cdc42bpbQ7TT50 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cdc42bpbQ7TT50 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cdc42bpbQ7TT50 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cdc42bpbQ7TT50 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cdc42bpbQ7TT50 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cdc42bpbQ7TT50 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cdc42bpbQ7TT50 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cdc42bpbQ7TT50 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Cdc42bpbQ7TT50 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cdc42bpbQ7TT50 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cdc42bpbQ7TT50 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cdc42bpbQ7TT50 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cdc42bpbQ7TT50 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cdc42bpbQ7TT50 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cdc42bpbQ7TT50 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cdc42bpbQ7TT50 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Cdc42bpbQ7TT50 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cdc42bpbQ7TT50 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cdc42bpbQ7TT50 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Cdc42bpbQ7TT50 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms