Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSL0

Ifnk, Interferon kappa, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfnkQ7TSL0 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IfnkQ7TSL0 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IfnkQ7TSL0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IfnkQ7TSL0 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IfnkQ7TSL0 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IfnkQ7TSL0 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IfnkQ7TSL0 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IfnkQ7TSL0 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IfnkQ7TSL0 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IfnkQ7TSL0 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IfnkQ7TSL0 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
IfnkQ7TSL0 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
IfnkQ7TSL0 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IfnkQ7TSL0 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IfnkQ7TSL0 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IfnkQ7TSL0 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IfnkQ7TSL0 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IfnkQ7TSL0 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IfnkQ7TSL0 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
IfnkQ7TSL0 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IfnkQ7TSL0 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IfnkQ7TSL0 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IfnkQ7TSL0 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IfnkQ7TSL0 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IfnkQ7TSL0 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IfnkQ7TSL0 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IfnkQ7TSL0 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IfnkQ7TSL0 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IfnkQ7TSL0 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IfnkQ7TSL0 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IfnkQ7TSL0 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IfnkQ7TSL0 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IfnkQ7TSL0 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IfnkQ7TSL0 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IfnkQ7TSL0 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IfnkQ7TSL0 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IfnkQ7TSL0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IfnkQ7TSL0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IfnkQ7TSL0 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IfnkQ7TSL0 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IfnkQ7TSL0 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IfnkQ7TSL0 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
IfnkQ7TSL0 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IfnkQ7TSL0 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IfnkQ7TSL0 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IfnkQ7TSL0 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IfnkQ7TSL0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IfnkQ7TSL0 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IfnkQ7TSL0 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IfnkQ7TSL0 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IfnkQ7TSL0 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IfnkQ7TSL0 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IfnkQ7TSL0 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IfnkQ7TSL0 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IfnkQ7TSL0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IfnkQ7TSL0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IfnkQ7TSL0 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IfnkQ7TSL0 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IfnkQ7TSL0 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IfnkQ7TSL0 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IfnkQ7TSL0 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IfnkQ7TSL0 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IfnkQ7TSL0 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IfnkQ7TSL0 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IfnkQ7TSL0 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IfnkQ7TSL0 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IfnkQ7TSL0 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IfnkQ7TSL0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IfnkQ7TSL0 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IfnkQ7TSL0 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
IfnkQ7TSL0 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IfnkQ7TSL0 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IfnkQ7TSL0 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IfnkQ7TSL0 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IfnkQ7TSL0 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IfnkQ7TSL0 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IfnkQ7TSL0 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IfnkQ7TSL0 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IfnkQ7TSL0 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IfnkQ7TSL0 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IfnkQ7TSL0 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IfnkQ7TSL0 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IfnkQ7TSL0 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IfnkQ7TSL0 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IfnkQ7TSL0 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IfnkQ7TSL0 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IfnkQ7TSL0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IfnkQ7TSL0 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IfnkQ7TSL0 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IfnkQ7TSL0 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IfnkQ7TSL0 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IfnkQ7TSL0 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IfnkQ7TSL0 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IfnkQ7TSL0 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IfnkQ7TSL0 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IfnkQ7TSL0 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IfnkQ7TSL0 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IfnkQ7TSL0 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IfnkQ7TSL0 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IfnkQ7TSL0 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms