Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prrc2bQ7TPM1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prrc2bQ7TPM1 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prrc2bQ7TPM1 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prrc2bQ7TPM1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Prrc2bQ7TPM1 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Prrc2bQ7TPM1 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Prrc2bQ7TPM1 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Prrc2bQ7TPM1 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Prrc2bQ7TPM1 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prrc2bQ7TPM1 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prrc2bQ7TPM1 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prrc2bQ7TPM1 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prrc2bQ7TPM1 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prrc2bQ7TPM1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prrc2bQ7TPM1 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prrc2bQ7TPM1 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prrc2bQ7TPM1 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Prrc2bQ7TPM1 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prrc2bQ7TPM1 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prrc2bQ7TPM1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prrc2bQ7TPM1 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prrc2bQ7TPM1 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prrc2bQ7TPM1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prrc2bQ7TPM1 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prrc2bQ7TPM1 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prrc2bQ7TPM1 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prrc2bQ7TPM1 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prrc2bQ7TPM1 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prrc2bQ7TPM1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prrc2bQ7TPM1 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prrc2bQ7TPM1 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prrc2bQ7TPM1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prrc2bQ7TPM1 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Prrc2bQ7TPM1 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prrc2bQ7TPM1 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prrc2bQ7TPM1 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prrc2bQ7TPM1 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prrc2bQ7TPM1 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prrc2bQ7TPM1 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prrc2bQ7TPM1 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prrc2bQ7TPM1 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prrc2bQ7TPM1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prrc2bQ7TPM1 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Prrc2bQ7TPM1 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prrc2bQ7TPM1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prrc2bQ7TPM1 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prrc2bQ7TPM1 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prrc2bQ7TPM1 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prrc2bQ7TPM1 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prrc2bQ7TPM1 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prrc2bQ7TPM1 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prrc2bQ7TPM1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prrc2bQ7TPM1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prrc2bQ7TPM1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prrc2bQ7TPM1 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prrc2bQ7TPM1 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prrc2bQ7TPM1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prrc2bQ7TPM1 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Prrc2bQ7TPM1 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prrc2bQ7TPM1 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prrc2bQ7TPM1 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prrc2bQ7TPM1 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prrc2bQ7TPM1 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prrc2bQ7TPM1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prrc2bQ7TPM1 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Prrc2bQ7TPM1 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prrc2bQ7TPM1 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Prrc2bQ7TPM1 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prrc2bQ7TPM1 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prrc2bQ7TPM1 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prrc2bQ7TPM1 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prrc2bQ7TPM1 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prrc2bQ7TPM1 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prrc2bQ7TPM1 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prrc2bQ7TPM1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prrc2bQ7TPM1 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prrc2bQ7TPM1 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prrc2bQ7TPM1 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Prrc2bQ7TPM1 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Prrc2bQ7TPM1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Prrc2bQ7TPM1 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Prrc2bQ7TPM1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Prrc2bQ7TPM1 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Prrc2bQ7TPM1 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prrc2bQ7TPM1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prrc2bQ7TPM1 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Prrc2bQ7TPM1 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prrc2bQ7TPM1 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Prrc2bQ7TPM1 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prrc2bQ7TPM1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prrc2bQ7TPM1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prrc2bQ7TPM1 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prrc2bQ7TPM1 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prrc2bQ7TPM1 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prrc2bQ7TPM1 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prrc2bQ7TPM1 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prrc2bQ7TPM1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prrc2bQ7TPM1 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prrc2bQ7TPM1 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms