Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN16

Hhip, Hedgehog-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HhipQ7TN16 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HhipQ7TN16 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HhipQ7TN16 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HhipQ7TN16 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HhipQ7TN16 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HhipQ7TN16 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HhipQ7TN16 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HhipQ7TN16 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HhipQ7TN16 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HhipQ7TN16 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HhipQ7TN16 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HhipQ7TN16 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
HhipQ7TN16 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
HhipQ7TN16 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HhipQ7TN16 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HhipQ7TN16 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HhipQ7TN16 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HhipQ7TN16 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HhipQ7TN16 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HhipQ7TN16 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HhipQ7TN16 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HhipQ7TN16 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HhipQ7TN16 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HhipQ7TN16 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HhipQ7TN16 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HhipQ7TN16 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HhipQ7TN16 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HhipQ7TN16 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HhipQ7TN16 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HhipQ7TN16 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HhipQ7TN16 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HhipQ7TN16 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HhipQ7TN16 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HhipQ7TN16 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HhipQ7TN16 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HhipQ7TN16 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HhipQ7TN16 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HhipQ7TN16 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HhipQ7TN16 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HhipQ7TN16 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HhipQ7TN16 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HhipQ7TN16 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HhipQ7TN16 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HhipQ7TN16 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HhipQ7TN16 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HhipQ7TN16 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HhipQ7TN16 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HhipQ7TN16 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HhipQ7TN16 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HhipQ7TN16 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HhipQ7TN16 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HhipQ7TN16 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HhipQ7TN16 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HhipQ7TN16 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HhipQ7TN16 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HhipQ7TN16 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HhipQ7TN16 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HhipQ7TN16 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HhipQ7TN16 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HhipQ7TN16 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HhipQ7TN16 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HhipQ7TN16 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HhipQ7TN16 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HhipQ7TN16 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HhipQ7TN16 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HhipQ7TN16 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HhipQ7TN16 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HhipQ7TN16 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HhipQ7TN16 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HhipQ7TN16 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HhipQ7TN16 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HhipQ7TN16 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HhipQ7TN16 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HhipQ7TN16 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HhipQ7TN16 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HhipQ7TN16 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HhipQ7TN16 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HhipQ7TN16 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HhipQ7TN16 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HhipQ7TN16 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HhipQ7TN16 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HhipQ7TN16 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HhipQ7TN16 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HhipQ7TN16 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HhipQ7TN16 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HhipQ7TN16 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HhipQ7TN16 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HhipQ7TN16 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HhipQ7TN16 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HhipQ7TN16 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HhipQ7TN16 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HhipQ7TN16 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HhipQ7TN16 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HhipQ7TN16 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HhipQ7TN16 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HhipQ7TN16 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HhipQ7TN16 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HhipQ7TN16 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HhipQ7TN16 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HhipQ7TN16 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms