Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQK0

Ncapd3, Condensin-2 complex subunit D3, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd3Q6ZQK0 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ncapd3Q6ZQK0 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ncapd3Q6ZQK0 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ncapd3Q6ZQK0 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ncapd3Q6ZQK0 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ncapd3Q6ZQK0 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ncapd3Q6ZQK0 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ncapd3Q6ZQK0 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ncapd3Q6ZQK0 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ncapd3Q6ZQK0 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ncapd3Q6ZQK0 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ncapd3Q6ZQK0 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ncapd3Q6ZQK0 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ncapd3Q6ZQK0 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ncapd3Q6ZQK0 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Ncapd3Q6ZQK0 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ncapd3Q6ZQK0 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ncapd3Q6ZQK0 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ncapd3Q6ZQK0 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ncapd3Q6ZQK0 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ncapd3Q6ZQK0 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ncapd3Q6ZQK0 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ncapd3Q6ZQK0 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ncapd3Q6ZQK0 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ncapd3Q6ZQK0 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ncapd3Q6ZQK0 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Ncapd3Q6ZQK0 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ncapd3Q6ZQK0 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ncapd3Q6ZQK0 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ncapd3Q6ZQK0 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ncapd3Q6ZQK0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Ncapd3Q6ZQK0 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Ncapd3Q6ZQK0 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ncapd3Q6ZQK0 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ncapd3Q6ZQK0 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ncapd3Q6ZQK0 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ncapd3Q6ZQK0 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ncapd3Q6ZQK0 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Ncapd3Q6ZQK0 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ncapd3Q6ZQK0 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ncapd3Q6ZQK0 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ncapd3Q6ZQK0 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ncapd3Q6ZQK0 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ncapd3Q6ZQK0 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ncapd3Q6ZQK0 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ncapd3Q6ZQK0 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ncapd3Q6ZQK0 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ncapd3Q6ZQK0 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ncapd3Q6ZQK0 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Ncapd3Q6ZQK0 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ncapd3Q6ZQK0 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ncapd3Q6ZQK0 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ncapd3Q6ZQK0 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ncapd3Q6ZQK0 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ncapd3Q6ZQK0 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ncapd3Q6ZQK0 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ncapd3Q6ZQK0 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ncapd3Q6ZQK0 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Ncapd3Q6ZQK0 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ncapd3Q6ZQK0 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ncapd3Q6ZQK0 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ncapd3Q6ZQK0 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ncapd3Q6ZQK0 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Ncapd3Q6ZQK0 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Ncapd3Q6ZQK0 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ncapd3Q6ZQK0 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ncapd3Q6ZQK0 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ncapd3Q6ZQK0 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ncapd3Q6ZQK0 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ncapd3Q6ZQK0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ncapd3Q6ZQK0 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ncapd3Q6ZQK0 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ncapd3Q6ZQK0 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ncapd3Q6ZQK0 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ncapd3Q6ZQK0 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ncapd3Q6ZQK0 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ncapd3Q6ZQK0 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ncapd3Q6ZQK0 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ncapd3Q6ZQK0 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ncapd3Q6ZQK0 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ncapd3Q6ZQK0 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ncapd3Q6ZQK0 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ncapd3Q6ZQK0 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ncapd3Q6ZQK0 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Ncapd3Q6ZQK0 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ncapd3Q6ZQK0 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ncapd3Q6ZQK0 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ncapd3Q6ZQK0 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ncapd3Q6ZQK0 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ncapd3Q6ZQK0 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
Ncapd3Q6ZQK0 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ncapd3Q6ZQK0 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ncapd3Q6ZQK0 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ncapd3Q6ZQK0 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ncapd3Q6ZQK0 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ncapd3Q6ZQK0 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ncapd3Q6ZQK0 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ncapd3Q6ZQK0 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ncapd3Q6ZQK0 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms