Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQA6

Igsf3, Immunoglobulin superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igsf3Q6ZQA6 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Igsf3Q6ZQA6 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Igsf3Q6ZQA6 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Igsf3Q6ZQA6 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Igsf3Q6ZQA6 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Igsf3Q6ZQA6 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Igsf3Q6ZQA6 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Igsf3Q6ZQA6 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Igsf3Q6ZQA6 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Igsf3Q6ZQA6 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Igsf3Q6ZQA6 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Igsf3Q6ZQA6 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Igsf3Q6ZQA6 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Igsf3Q6ZQA6 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Igsf3Q6ZQA6 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Igsf3Q6ZQA6 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Igsf3Q6ZQA6 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Igsf3Q6ZQA6 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Igsf3Q6ZQA6 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Igsf3Q6ZQA6 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Igsf3Q6ZQA6 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Igsf3Q6ZQA6 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Igsf3Q6ZQA6 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Igsf3Q6ZQA6 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Igsf3Q6ZQA6 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Igsf3Q6ZQA6 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Igsf3Q6ZQA6 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Igsf3Q6ZQA6 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Igsf3Q6ZQA6 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Igsf3Q6ZQA6 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Igsf3Q6ZQA6 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Igsf3Q6ZQA6 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Igsf3Q6ZQA6 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Igsf3Q6ZQA6 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Igsf3Q6ZQA6 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Igsf3Q6ZQA6 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Igsf3Q6ZQA6 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Igsf3Q6ZQA6 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Igsf3Q6ZQA6 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Igsf3Q6ZQA6 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Igsf3Q6ZQA6 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Igsf3Q6ZQA6 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Igsf3Q6ZQA6 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Igsf3Q6ZQA6 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Igsf3Q6ZQA6 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Igsf3Q6ZQA6 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Igsf3Q6ZQA6 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Igsf3Q6ZQA6 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Igsf3Q6ZQA6 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Igsf3Q6ZQA6 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Igsf3Q6ZQA6 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Igsf3Q6ZQA6 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Igsf3Q6ZQA6 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Igsf3Q6ZQA6 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Igsf3Q6ZQA6 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Igsf3Q6ZQA6 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Igsf3Q6ZQA6 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Igsf3Q6ZQA6 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Igsf3Q6ZQA6 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Igsf3Q6ZQA6 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Igsf3Q6ZQA6 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Igsf3Q6ZQA6 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Igsf3Q6ZQA6 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Igsf3Q6ZQA6 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Igsf3Q6ZQA6 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Igsf3Q6ZQA6 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Igsf3Q6ZQA6 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Igsf3Q6ZQA6 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Igsf3Q6ZQA6 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Igsf3Q6ZQA6 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Igsf3Q6ZQA6 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Igsf3Q6ZQA6 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Igsf3Q6ZQA6 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Igsf3Q6ZQA6 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Igsf3Q6ZQA6 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Igsf3Q6ZQA6 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Igsf3Q6ZQA6 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Igsf3Q6ZQA6 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Igsf3Q6ZQA6 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Igsf3Q6ZQA6 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Igsf3Q6ZQA6 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Igsf3Q6ZQA6 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Igsf3Q6ZQA6 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Igsf3Q6ZQA6 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Igsf3Q6ZQA6 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Igsf3Q6ZQA6 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Igsf3Q6ZQA6 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Igsf3Q6ZQA6 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Igsf3Q6ZQA6 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Igsf3Q6ZQA6 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Igsf3Q6ZQA6 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Igsf3Q6ZQA6 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Igsf3Q6ZQA6 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Igsf3Q6ZQA6 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Igsf3Q6ZQA6 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Igsf3Q6ZQA6 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Igsf3Q6ZQA6 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Igsf3Q6ZQA6 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Igsf3Q6ZQA6 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Igsf3Q6ZQA6 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms