Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc88cQ6VGS5 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc88cQ6VGS5 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc88cQ6VGS5 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc88cQ6VGS5 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc88cQ6VGS5 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc88cQ6VGS5 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc88cQ6VGS5 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc88cQ6VGS5 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc88cQ6VGS5 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc88cQ6VGS5 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc88cQ6VGS5 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc88cQ6VGS5 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc88cQ6VGS5 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc88cQ6VGS5 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc88cQ6VGS5 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc88cQ6VGS5 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc88cQ6VGS5 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc88cQ6VGS5 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc88cQ6VGS5 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Ccdc88cQ6VGS5 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Ccdc88cQ6VGS5 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc88cQ6VGS5 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc88cQ6VGS5 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc88cQ6VGS5 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc88cQ6VGS5 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc88cQ6VGS5 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc88cQ6VGS5 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc88cQ6VGS5 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc88cQ6VGS5 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc88cQ6VGS5 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc88cQ6VGS5 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc88cQ6VGS5 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc88cQ6VGS5 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc88cQ6VGS5 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc88cQ6VGS5 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc88cQ6VGS5 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc88cQ6VGS5 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc88cQ6VGS5 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc88cQ6VGS5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc88cQ6VGS5 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc88cQ6VGS5 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc88cQ6VGS5 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc88cQ6VGS5 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc88cQ6VGS5 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc88cQ6VGS5 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc88cQ6VGS5 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc88cQ6VGS5 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc88cQ6VGS5 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc88cQ6VGS5 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc88cQ6VGS5 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc88cQ6VGS5 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc88cQ6VGS5 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc88cQ6VGS5 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc88cQ6VGS5 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc88cQ6VGS5 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc88cQ6VGS5 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc88cQ6VGS5 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc88cQ6VGS5 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc88cQ6VGS5 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc88cQ6VGS5 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc88cQ6VGS5 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc88cQ6VGS5 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc88cQ6VGS5 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc88cQ6VGS5 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc88cQ6VGS5 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc88cQ6VGS5 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc88cQ6VGS5 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc88cQ6VGS5 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc88cQ6VGS5 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc88cQ6VGS5 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc88cQ6VGS5 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc88cQ6VGS5 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc88cQ6VGS5 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc88cQ6VGS5 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc88cQ6VGS5 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc88cQ6VGS5 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc88cQ6VGS5 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc88cQ6VGS5 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc88cQ6VGS5 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc88cQ6VGS5 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc88cQ6VGS5 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc88cQ6VGS5 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc88cQ6VGS5 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc88cQ6VGS5 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc88cQ6VGS5 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc88cQ6VGS5 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms