Protein–RNA interactions for Protein: Q6QD59

Bnip1, Vesicle transport protein SEC20, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnip1Q6QD59 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bnip1Q6QD59 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bnip1Q6QD59 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bnip1Q6QD59 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bnip1Q6QD59 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bnip1Q6QD59 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bnip1Q6QD59 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bnip1Q6QD59 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bnip1Q6QD59 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bnip1Q6QD59 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bnip1Q6QD59 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bnip1Q6QD59 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bnip1Q6QD59 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bnip1Q6QD59 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bnip1Q6QD59 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bnip1Q6QD59 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bnip1Q6QD59 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bnip1Q6QD59 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bnip1Q6QD59 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bnip1Q6QD59 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bnip1Q6QD59 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bnip1Q6QD59 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bnip1Q6QD59 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bnip1Q6QD59 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bnip1Q6QD59 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bnip1Q6QD59 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bnip1Q6QD59 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bnip1Q6QD59 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bnip1Q6QD59 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bnip1Q6QD59 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bnip1Q6QD59 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bnip1Q6QD59 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bnip1Q6QD59 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bnip1Q6QD59 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bnip1Q6QD59 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bnip1Q6QD59 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bnip1Q6QD59 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bnip1Q6QD59 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Bnip1Q6QD59 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Bnip1Q6QD59 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Bnip1Q6QD59 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bnip1Q6QD59 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bnip1Q6QD59 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bnip1Q6QD59 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bnip1Q6QD59 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bnip1Q6QD59 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bnip1Q6QD59 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bnip1Q6QD59 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bnip1Q6QD59 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bnip1Q6QD59 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bnip1Q6QD59 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bnip1Q6QD59 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bnip1Q6QD59 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bnip1Q6QD59 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bnip1Q6QD59 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bnip1Q6QD59 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bnip1Q6QD59 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bnip1Q6QD59 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bnip1Q6QD59 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bnip1Q6QD59 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bnip1Q6QD59 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bnip1Q6QD59 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bnip1Q6QD59 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bnip1Q6QD59 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bnip1Q6QD59 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bnip1Q6QD59 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bnip1Q6QD59 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bnip1Q6QD59 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bnip1Q6QD59 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bnip1Q6QD59 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bnip1Q6QD59 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bnip1Q6QD59 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bnip1Q6QD59 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bnip1Q6QD59 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bnip1Q6QD59 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bnip1Q6QD59 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bnip1Q6QD59 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bnip1Q6QD59 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bnip1Q6QD59 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bnip1Q6QD59 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bnip1Q6QD59 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bnip1Q6QD59 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bnip1Q6QD59 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bnip1Q6QD59 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bnip1Q6QD59 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bnip1Q6QD59 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bnip1Q6QD59 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bnip1Q6QD59 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bnip1Q6QD59 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bnip1Q6QD59 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bnip1Q6QD59 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bnip1Q6QD59 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Bnip1Q6QD59 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bnip1Q6QD59 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bnip1Q6QD59 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bnip1Q6QD59 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bnip1Q6QD59 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bnip1Q6QD59 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bnip1Q6QD59 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bnip1Q6QD59 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms