Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIP5

Nudcd1, NudC domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd1Q6PIP5 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nudcd1Q6PIP5 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nudcd1Q6PIP5 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nudcd1Q6PIP5 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nudcd1Q6PIP5 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nudcd1Q6PIP5 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nudcd1Q6PIP5 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nudcd1Q6PIP5 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nudcd1Q6PIP5 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nudcd1Q6PIP5 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Nudcd1Q6PIP5 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nudcd1Q6PIP5 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nudcd1Q6PIP5 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nudcd1Q6PIP5 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nudcd1Q6PIP5 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nudcd1Q6PIP5 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nudcd1Q6PIP5 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nudcd1Q6PIP5 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nudcd1Q6PIP5 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nudcd1Q6PIP5 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nudcd1Q6PIP5 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nudcd1Q6PIP5 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nudcd1Q6PIP5 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nudcd1Q6PIP5 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nudcd1Q6PIP5 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nudcd1Q6PIP5 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nudcd1Q6PIP5 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nudcd1Q6PIP5 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nudcd1Q6PIP5 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nudcd1Q6PIP5 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nudcd1Q6PIP5 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Nudcd1Q6PIP5 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nudcd1Q6PIP5 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nudcd1Q6PIP5 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nudcd1Q6PIP5 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Nudcd1Q6PIP5 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nudcd1Q6PIP5 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nudcd1Q6PIP5 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Nudcd1Q6PIP5 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Nudcd1Q6PIP5 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nudcd1Q6PIP5 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nudcd1Q6PIP5 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nudcd1Q6PIP5 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nudcd1Q6PIP5 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nudcd1Q6PIP5 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nudcd1Q6PIP5 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nudcd1Q6PIP5 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nudcd1Q6PIP5 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nudcd1Q6PIP5 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nudcd1Q6PIP5 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nudcd1Q6PIP5 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nudcd1Q6PIP5 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nudcd1Q6PIP5 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nudcd1Q6PIP5 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nudcd1Q6PIP5 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nudcd1Q6PIP5 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nudcd1Q6PIP5 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nudcd1Q6PIP5 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nudcd1Q6PIP5 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nudcd1Q6PIP5 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nudcd1Q6PIP5 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nudcd1Q6PIP5 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nudcd1Q6PIP5 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nudcd1Q6PIP5 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nudcd1Q6PIP5 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nudcd1Q6PIP5 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nudcd1Q6PIP5 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nudcd1Q6PIP5 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nudcd1Q6PIP5 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nudcd1Q6PIP5 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nudcd1Q6PIP5 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nudcd1Q6PIP5 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nudcd1Q6PIP5 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nudcd1Q6PIP5 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nudcd1Q6PIP5 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nudcd1Q6PIP5 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nudcd1Q6PIP5 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nudcd1Q6PIP5 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nudcd1Q6PIP5 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nudcd1Q6PIP5 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nudcd1Q6PIP5 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nudcd1Q6PIP5 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nudcd1Q6PIP5 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nudcd1Q6PIP5 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nudcd1Q6PIP5 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nudcd1Q6PIP5 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nudcd1Q6PIP5 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nudcd1Q6PIP5 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nudcd1Q6PIP5 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nudcd1Q6PIP5 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nudcd1Q6PIP5 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nudcd1Q6PIP5 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nudcd1Q6PIP5 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nudcd1Q6PIP5 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Nudcd1Q6PIP5 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nudcd1Q6PIP5 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nudcd1Q6PIP5 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nudcd1Q6PIP5 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nudcd1Q6PIP5 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nudcd1Q6PIP5 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms