Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGF3

Med16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med16Q6PGF3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Med16Q6PGF3 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Med16Q6PGF3 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Med16Q6PGF3 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Med16Q6PGF3 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Med16Q6PGF3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Med16Q6PGF3 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Med16Q6PGF3 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Med16Q6PGF3 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Med16Q6PGF3 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Med16Q6PGF3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Med16Q6PGF3 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Med16Q6PGF3 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Med16Q6PGF3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Med16Q6PGF3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Med16Q6PGF3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Med16Q6PGF3 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Med16Q6PGF3 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Med16Q6PGF3 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Med16Q6PGF3 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Med16Q6PGF3 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Med16Q6PGF3 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Med16Q6PGF3 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Med16Q6PGF3 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Med16Q6PGF3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Med16Q6PGF3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Med16Q6PGF3 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Med16Q6PGF3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Med16Q6PGF3 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Med16Q6PGF3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Med16Q6PGF3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Med16Q6PGF3 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Med16Q6PGF3 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Med16Q6PGF3 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Med16Q6PGF3 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Med16Q6PGF3 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Med16Q6PGF3 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Med16Q6PGF3 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Med16Q6PGF3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Med16Q6PGF3 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Med16Q6PGF3 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Med16Q6PGF3 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Med16Q6PGF3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Med16Q6PGF3 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Med16Q6PGF3 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Med16Q6PGF3 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Med16Q6PGF3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Med16Q6PGF3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Med16Q6PGF3 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Med16Q6PGF3 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Med16Q6PGF3 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Med16Q6PGF3 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Med16Q6PGF3 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Med16Q6PGF3 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Med16Q6PGF3 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Med16Q6PGF3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Med16Q6PGF3 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Med16Q6PGF3 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Med16Q6PGF3 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Med16Q6PGF3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Med16Q6PGF3 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Med16Q6PGF3 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Med16Q6PGF3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Med16Q6PGF3 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Med16Q6PGF3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Med16Q6PGF3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Med16Q6PGF3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Med16Q6PGF3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Med16Q6PGF3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Med16Q6PGF3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Med16Q6PGF3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Med16Q6PGF3 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Med16Q6PGF3 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Med16Q6PGF3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Med16Q6PGF3 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Med16Q6PGF3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Med16Q6PGF3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Med16Q6PGF3 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Med16Q6PGF3 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Med16Q6PGF3 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Med16Q6PGF3 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Med16Q6PGF3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Med16Q6PGF3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Med16Q6PGF3 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Med16Q6PGF3 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Med16Q6PGF3 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Med16Q6PGF3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Med16Q6PGF3 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Med16Q6PGF3 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Med16Q6PGF3 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Med16Q6PGF3 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Med16Q6PGF3 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Med16Q6PGF3 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Med16Q6PGF3 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Med16Q6PGF3 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Med16Q6PGF3 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Med16Q6PGF3 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Med16Q6PGF3 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Med16Q6PGF3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Med16Q6PGF3 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms