Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEM8

Slc46a1, Proton-coupled folate transporter, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc46a1Q6PEM8 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc46a1Q6PEM8 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc46a1Q6PEM8 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc46a1Q6PEM8 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc46a1Q6PEM8 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc46a1Q6PEM8 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc46a1Q6PEM8 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc46a1Q6PEM8 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc46a1Q6PEM8 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc46a1Q6PEM8 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc46a1Q6PEM8 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc46a1Q6PEM8 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc46a1Q6PEM8 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc46a1Q6PEM8 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc46a1Q6PEM8 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc46a1Q6PEM8 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc46a1Q6PEM8 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc46a1Q6PEM8 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc46a1Q6PEM8 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc46a1Q6PEM8 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc46a1Q6PEM8 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc46a1Q6PEM8 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc46a1Q6PEM8 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc46a1Q6PEM8 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc46a1Q6PEM8 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc46a1Q6PEM8 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc46a1Q6PEM8 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc46a1Q6PEM8 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc46a1Q6PEM8 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc46a1Q6PEM8 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc46a1Q6PEM8 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc46a1Q6PEM8 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc46a1Q6PEM8 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc46a1Q6PEM8 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc46a1Q6PEM8 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc46a1Q6PEM8 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc46a1Q6PEM8 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc46a1Q6PEM8 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc46a1Q6PEM8 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc46a1Q6PEM8 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc46a1Q6PEM8 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc46a1Q6PEM8 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc46a1Q6PEM8 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc46a1Q6PEM8 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc46a1Q6PEM8 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc46a1Q6PEM8 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc46a1Q6PEM8 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc46a1Q6PEM8 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc46a1Q6PEM8 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc46a1Q6PEM8 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc46a1Q6PEM8 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc46a1Q6PEM8 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc46a1Q6PEM8 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc46a1Q6PEM8 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc46a1Q6PEM8 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc46a1Q6PEM8 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc46a1Q6PEM8 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc46a1Q6PEM8 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc46a1Q6PEM8 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc46a1Q6PEM8 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc46a1Q6PEM8 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc46a1Q6PEM8 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc46a1Q6PEM8 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc46a1Q6PEM8 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc46a1Q6PEM8 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc46a1Q6PEM8 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc46a1Q6PEM8 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc46a1Q6PEM8 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc46a1Q6PEM8 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc46a1Q6PEM8 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc46a1Q6PEM8 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc46a1Q6PEM8 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc46a1Q6PEM8 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc46a1Q6PEM8 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc46a1Q6PEM8 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc46a1Q6PEM8 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc46a1Q6PEM8 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc46a1Q6PEM8 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc46a1Q6PEM8 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc46a1Q6PEM8 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc46a1Q6PEM8 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc46a1Q6PEM8 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc46a1Q6PEM8 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc46a1Q6PEM8 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc46a1Q6PEM8 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc46a1Q6PEM8 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc46a1Q6PEM8 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc46a1Q6PEM8 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc46a1Q6PEM8 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc46a1Q6PEM8 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc46a1Q6PEM8 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc46a1Q6PEM8 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc46a1Q6PEM8 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc46a1Q6PEM8 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc46a1Q6PEM8 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc46a1Q6PEM8 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc46a1Q6PEM8 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc46a1Q6PEM8 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc46a1Q6PEM8 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc46a1Q6PEM8 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.1 ms