Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDM4

Ccdc36, Interactor of HORMAD1 protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc36Q6PDM4 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms