Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDC8

Mfsd4a, Major facilitator superfamily domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd4aQ6PDC8 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mfsd4aQ6PDC8 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mfsd4aQ6PDC8 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mfsd4aQ6PDC8 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mfsd4aQ6PDC8 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mfsd4aQ6PDC8 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mfsd4aQ6PDC8 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mfsd4aQ6PDC8 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mfsd4aQ6PDC8 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mfsd4aQ6PDC8 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mfsd4aQ6PDC8 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mfsd4aQ6PDC8 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mfsd4aQ6PDC8 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mfsd4aQ6PDC8 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mfsd4aQ6PDC8 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mfsd4aQ6PDC8 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mfsd4aQ6PDC8 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mfsd4aQ6PDC8 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mfsd4aQ6PDC8 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mfsd4aQ6PDC8 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mfsd4aQ6PDC8 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mfsd4aQ6PDC8 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mfsd4aQ6PDC8 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mfsd4aQ6PDC8 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mfsd4aQ6PDC8 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mfsd4aQ6PDC8 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mfsd4aQ6PDC8 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mfsd4aQ6PDC8 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mfsd4aQ6PDC8 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mfsd4aQ6PDC8 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mfsd4aQ6PDC8 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mfsd4aQ6PDC8 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mfsd4aQ6PDC8 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mfsd4aQ6PDC8 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mfsd4aQ6PDC8 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mfsd4aQ6PDC8 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mfsd4aQ6PDC8 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Mfsd4aQ6PDC8 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mfsd4aQ6PDC8 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mfsd4aQ6PDC8 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mfsd4aQ6PDC8 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mfsd4aQ6PDC8 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mfsd4aQ6PDC8 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mfsd4aQ6PDC8 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mfsd4aQ6PDC8 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mfsd4aQ6PDC8 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Mfsd4aQ6PDC8 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mfsd4aQ6PDC8 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mfsd4aQ6PDC8 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mfsd4aQ6PDC8 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mfsd4aQ6PDC8 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mfsd4aQ6PDC8 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mfsd4aQ6PDC8 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mfsd4aQ6PDC8 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mfsd4aQ6PDC8 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mfsd4aQ6PDC8 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mfsd4aQ6PDC8 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mfsd4aQ6PDC8 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mfsd4aQ6PDC8 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mfsd4aQ6PDC8 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mfsd4aQ6PDC8 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mfsd4aQ6PDC8 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mfsd4aQ6PDC8 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mfsd4aQ6PDC8 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mfsd4aQ6PDC8 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mfsd4aQ6PDC8 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mfsd4aQ6PDC8 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mfsd4aQ6PDC8 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mfsd4aQ6PDC8 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mfsd4aQ6PDC8 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mfsd4aQ6PDC8 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mfsd4aQ6PDC8 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mfsd4aQ6PDC8 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mfsd4aQ6PDC8 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Mfsd4aQ6PDC8 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Mfsd4aQ6PDC8 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mfsd4aQ6PDC8 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mfsd4aQ6PDC8 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mfsd4aQ6PDC8 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mfsd4aQ6PDC8 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mfsd4aQ6PDC8 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mfsd4aQ6PDC8 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mfsd4aQ6PDC8 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mfsd4aQ6PDC8 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mfsd4aQ6PDC8 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Mfsd4aQ6PDC8 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Mfsd4aQ6PDC8 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mfsd4aQ6PDC8 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mfsd4aQ6PDC8 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mfsd4aQ6PDC8 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mfsd4aQ6PDC8 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mfsd4aQ6PDC8 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mfsd4aQ6PDC8 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mfsd4aQ6PDC8 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mfsd4aQ6PDC8 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mfsd4aQ6PDC8 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mfsd4aQ6PDC8 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mfsd4aQ6PDC8 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mfsd4aQ6PDC8 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mfsd4aQ6PDC8 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms