Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trak1Q6PD31 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trak1Q6PD31 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Trak1Q6PD31 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trak1Q6PD31 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Trak1Q6PD31 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trak1Q6PD31 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trak1Q6PD31 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trak1Q6PD31 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trak1Q6PD31 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trak1Q6PD31 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trak1Q6PD31 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trak1Q6PD31 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trak1Q6PD31 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trak1Q6PD31 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Trak1Q6PD31 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trak1Q6PD31 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Trak1Q6PD31 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trak1Q6PD31 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trak1Q6PD31 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trak1Q6PD31 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trak1Q6PD31 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trak1Q6PD31 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trak1Q6PD31 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trak1Q6PD31 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trak1Q6PD31 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trak1Q6PD31 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trak1Q6PD31 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Trak1Q6PD31 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trak1Q6PD31 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trak1Q6PD31 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trak1Q6PD31 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Trak1Q6PD31 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trak1Q6PD31 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trak1Q6PD31 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trak1Q6PD31 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trak1Q6PD31 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trak1Q6PD31 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trak1Q6PD31 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trak1Q6PD31 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trak1Q6PD31 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trak1Q6PD31 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Trak1Q6PD31 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Trak1Q6PD31 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trak1Q6PD31 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trak1Q6PD31 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Trak1Q6PD31 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trak1Q6PD31 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trak1Q6PD31 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trak1Q6PD31 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trak1Q6PD31 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trak1Q6PD31 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trak1Q6PD31 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trak1Q6PD31 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trak1Q6PD31 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trak1Q6PD31 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trak1Q6PD31 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trak1Q6PD31 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trak1Q6PD31 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trak1Q6PD31 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trak1Q6PD31 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trak1Q6PD31 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trak1Q6PD31 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trak1Q6PD31 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trak1Q6PD31 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Trak1Q6PD31 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trak1Q6PD31 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trak1Q6PD31 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trak1Q6PD31 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trak1Q6PD31 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trak1Q6PD31 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trak1Q6PD31 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trak1Q6PD31 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trak1Q6PD31 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trak1Q6PD31 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trak1Q6PD31 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Trak1Q6PD31 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trak1Q6PD31 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trak1Q6PD31 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trak1Q6PD31 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trak1Q6PD31 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trak1Q6PD31 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trak1Q6PD31 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trak1Q6PD31 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trak1Q6PD31 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trak1Q6PD31 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trak1Q6PD31 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trak1Q6PD31 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trak1Q6PD31 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Trak1Q6PD31 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Trak1Q6PD31 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trak1Q6PD31 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trak1Q6PD31 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trak1Q6PD31 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trak1Q6PD31 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trak1Q6PD31 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trak1Q6PD31 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trak1Q6PD31 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trak1Q6PD31 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trak1Q6PD31 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms