Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAM0

Prkab2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkab2Q6PAM0 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Prkab2Q6PAM0 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Prkab2Q6PAM0 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Prkab2Q6PAM0 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prkab2Q6PAM0 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Prkab2Q6PAM0 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prkab2Q6PAM0 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prkab2Q6PAM0 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prkab2Q6PAM0 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prkab2Q6PAM0 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prkab2Q6PAM0 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prkab2Q6PAM0 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prkab2Q6PAM0 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prkab2Q6PAM0 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prkab2Q6PAM0 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prkab2Q6PAM0 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prkab2Q6PAM0 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prkab2Q6PAM0 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prkab2Q6PAM0 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prkab2Q6PAM0 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prkab2Q6PAM0 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prkab2Q6PAM0 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prkab2Q6PAM0 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prkab2Q6PAM0 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prkab2Q6PAM0 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prkab2Q6PAM0 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Prkab2Q6PAM0 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prkab2Q6PAM0 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Prkab2Q6PAM0 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prkab2Q6PAM0 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prkab2Q6PAM0 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prkab2Q6PAM0 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prkab2Q6PAM0 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prkab2Q6PAM0 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prkab2Q6PAM0 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prkab2Q6PAM0 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prkab2Q6PAM0 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prkab2Q6PAM0 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Prkab2Q6PAM0 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prkab2Q6PAM0 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prkab2Q6PAM0 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prkab2Q6PAM0 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prkab2Q6PAM0 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prkab2Q6PAM0 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prkab2Q6PAM0 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prkab2Q6PAM0 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prkab2Q6PAM0 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prkab2Q6PAM0 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prkab2Q6PAM0 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prkab2Q6PAM0 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prkab2Q6PAM0 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prkab2Q6PAM0 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prkab2Q6PAM0 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prkab2Q6PAM0 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Prkab2Q6PAM0 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prkab2Q6PAM0 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prkab2Q6PAM0 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prkab2Q6PAM0 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prkab2Q6PAM0 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prkab2Q6PAM0 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prkab2Q6PAM0 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prkab2Q6PAM0 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prkab2Q6PAM0 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prkab2Q6PAM0 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prkab2Q6PAM0 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prkab2Q6PAM0 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prkab2Q6PAM0 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Prkab2Q6PAM0 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prkab2Q6PAM0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prkab2Q6PAM0 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prkab2Q6PAM0 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prkab2Q6PAM0 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prkab2Q6PAM0 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prkab2Q6PAM0 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prkab2Q6PAM0 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prkab2Q6PAM0 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prkab2Q6PAM0 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prkab2Q6PAM0 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prkab2Q6PAM0 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prkab2Q6PAM0 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prkab2Q6PAM0 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Prkab2Q6PAM0 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prkab2Q6PAM0 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prkab2Q6PAM0 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prkab2Q6PAM0 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prkab2Q6PAM0 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prkab2Q6PAM0 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Prkab2Q6PAM0 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Prkab2Q6PAM0 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Prkab2Q6PAM0 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Prkab2Q6PAM0 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Prkab2Q6PAM0 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prkab2Q6PAM0 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prkab2Q6PAM0 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prkab2Q6PAM0 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prkab2Q6PAM0 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prkab2Q6PAM0 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prkab2Q6PAM0 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prkab2Q6PAM0 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Prkab2Q6PAM0 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms