Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9Q4

Fhod1, FH1/FH2 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fhod1Q6P9Q4 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Fhod1Q6P9Q4 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Fhod1Q6P9Q4 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Fhod1Q6P9Q4 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Fhod1Q6P9Q4 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Fhod1Q6P9Q4 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Fhod1Q6P9Q4 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Fhod1Q6P9Q4 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Fhod1Q6P9Q4 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fhod1Q6P9Q4 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fhod1Q6P9Q4 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fhod1Q6P9Q4 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fhod1Q6P9Q4 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fhod1Q6P9Q4 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fhod1Q6P9Q4 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fhod1Q6P9Q4 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fhod1Q6P9Q4 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fhod1Q6P9Q4 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fhod1Q6P9Q4 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fhod1Q6P9Q4 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fhod1Q6P9Q4 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fhod1Q6P9Q4 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fhod1Q6P9Q4 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fhod1Q6P9Q4 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fhod1Q6P9Q4 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fhod1Q6P9Q4 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fhod1Q6P9Q4 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fhod1Q6P9Q4 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fhod1Q6P9Q4 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fhod1Q6P9Q4 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fhod1Q6P9Q4 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Fhod1Q6P9Q4 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fhod1Q6P9Q4 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fhod1Q6P9Q4 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fhod1Q6P9Q4 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fhod1Q6P9Q4 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fhod1Q6P9Q4 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fhod1Q6P9Q4 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fhod1Q6P9Q4 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fhod1Q6P9Q4 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fhod1Q6P9Q4 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fhod1Q6P9Q4 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fhod1Q6P9Q4 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fhod1Q6P9Q4 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fhod1Q6P9Q4 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fhod1Q6P9Q4 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fhod1Q6P9Q4 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fhod1Q6P9Q4 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fhod1Q6P9Q4 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fhod1Q6P9Q4 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fhod1Q6P9Q4 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fhod1Q6P9Q4 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fhod1Q6P9Q4 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fhod1Q6P9Q4 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Fhod1Q6P9Q4 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fhod1Q6P9Q4 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fhod1Q6P9Q4 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fhod1Q6P9Q4 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fhod1Q6P9Q4 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fhod1Q6P9Q4 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fhod1Q6P9Q4 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fhod1Q6P9Q4 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fhod1Q6P9Q4 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fhod1Q6P9Q4 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Fhod1Q6P9Q4 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fhod1Q6P9Q4 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fhod1Q6P9Q4 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fhod1Q6P9Q4 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fhod1Q6P9Q4 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fhod1Q6P9Q4 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fhod1Q6P9Q4 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fhod1Q6P9Q4 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fhod1Q6P9Q4 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fhod1Q6P9Q4 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fhod1Q6P9Q4 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fhod1Q6P9Q4 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fhod1Q6P9Q4 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fhod1Q6P9Q4 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fhod1Q6P9Q4 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fhod1Q6P9Q4 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fhod1Q6P9Q4 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fhod1Q6P9Q4 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fhod1Q6P9Q4 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Fhod1Q6P9Q4 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fhod1Q6P9Q4 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fhod1Q6P9Q4 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fhod1Q6P9Q4 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Fhod1Q6P9Q4 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fhod1Q6P9Q4 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fhod1Q6P9Q4 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fhod1Q6P9Q4 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fhod1Q6P9Q4 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fhod1Q6P9Q4 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fhod1Q6P9Q4 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Fhod1Q6P9Q4 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Fhod1Q6P9Q4 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Fhod1Q6P9Q4 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Fhod1Q6P9Q4 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Fhod1Q6P9Q4 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Fhod1Q6P9Q4 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms