Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9P0

Slf2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slf2Q6P9P0 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slf2Q6P9P0 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slf2Q6P9P0 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slf2Q6P9P0 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slf2Q6P9P0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slf2Q6P9P0 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slf2Q6P9P0 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slf2Q6P9P0 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slf2Q6P9P0 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slf2Q6P9P0 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slf2Q6P9P0 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slf2Q6P9P0 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slf2Q6P9P0 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slf2Q6P9P0 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slf2Q6P9P0 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slf2Q6P9P0 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slf2Q6P9P0 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slf2Q6P9P0 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slf2Q6P9P0 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slf2Q6P9P0 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slf2Q6P9P0 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slf2Q6P9P0 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slf2Q6P9P0 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slf2Q6P9P0 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slf2Q6P9P0 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Slf2Q6P9P0 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slf2Q6P9P0 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Slf2Q6P9P0 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slf2Q6P9P0 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slf2Q6P9P0 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slf2Q6P9P0 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slf2Q6P9P0 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slf2Q6P9P0 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slf2Q6P9P0 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slf2Q6P9P0 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Slf2Q6P9P0 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slf2Q6P9P0 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slf2Q6P9P0 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slf2Q6P9P0 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slf2Q6P9P0 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slf2Q6P9P0 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slf2Q6P9P0 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slf2Q6P9P0 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slf2Q6P9P0 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slf2Q6P9P0 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slf2Q6P9P0 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slf2Q6P9P0 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slf2Q6P9P0 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Slf2Q6P9P0 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slf2Q6P9P0 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slf2Q6P9P0 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slf2Q6P9P0 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slf2Q6P9P0 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slf2Q6P9P0 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Slf2Q6P9P0 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Slf2Q6P9P0 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Slf2Q6P9P0 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Slf2Q6P9P0 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Slf2Q6P9P0 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Slf2Q6P9P0 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Slf2Q6P9P0 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slf2Q6P9P0 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slf2Q6P9P0 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slf2Q6P9P0 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slf2Q6P9P0 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slf2Q6P9P0 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slf2Q6P9P0 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slf2Q6P9P0 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slf2Q6P9P0 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slf2Q6P9P0 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slf2Q6P9P0 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slf2Q6P9P0 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slf2Q6P9P0 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slf2Q6P9P0 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slf2Q6P9P0 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slf2Q6P9P0 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slf2Q6P9P0 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slf2Q6P9P0 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Slf2Q6P9P0 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slf2Q6P9P0 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slf2Q6P9P0 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slf2Q6P9P0 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slf2Q6P9P0 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slf2Q6P9P0 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slf2Q6P9P0 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slf2Q6P9P0 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slf2Q6P9P0 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slf2Q6P9P0 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slf2Q6P9P0 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slf2Q6P9P0 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slf2Q6P9P0 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slf2Q6P9P0 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Slf2Q6P9P0 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slf2Q6P9P0 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slf2Q6P9P0 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slf2Q6P9P0 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slf2Q6P9P0 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slf2Q6P9P0 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slf2Q6P9P0 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slf2Q6P9P0 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms