Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Usp49Q6P9L4 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Usp49Q6P9L4 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Usp49Q6P9L4 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Usp49Q6P9L4 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Usp49Q6P9L4 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Usp49Q6P9L4 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Usp49Q6P9L4 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Usp49Q6P9L4 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Usp49Q6P9L4 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Usp49Q6P9L4 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Usp49Q6P9L4 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Usp49Q6P9L4 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Usp49Q6P9L4 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Usp49Q6P9L4 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Usp49Q6P9L4 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Usp49Q6P9L4 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Usp49Q6P9L4 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Usp49Q6P9L4 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Usp49Q6P9L4 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Usp49Q6P9L4 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp49Q6P9L4 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp49Q6P9L4 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp49Q6P9L4 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp49Q6P9L4 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp49Q6P9L4 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp49Q6P9L4 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp49Q6P9L4 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp49Q6P9L4 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp49Q6P9L4 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp49Q6P9L4 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp49Q6P9L4 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp49Q6P9L4 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp49Q6P9L4 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp49Q6P9L4 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp49Q6P9L4 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp49Q6P9L4 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp49Q6P9L4 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp49Q6P9L4 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp49Q6P9L4 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp49Q6P9L4 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp49Q6P9L4 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp49Q6P9L4 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp49Q6P9L4 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp49Q6P9L4 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp49Q6P9L4 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp49Q6P9L4 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp49Q6P9L4 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp49Q6P9L4 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp49Q6P9L4 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp49Q6P9L4 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp49Q6P9L4 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp49Q6P9L4 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp49Q6P9L4 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp49Q6P9L4 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp49Q6P9L4 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp49Q6P9L4 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp49Q6P9L4 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp49Q6P9L4 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp49Q6P9L4 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp49Q6P9L4 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp49Q6P9L4 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp49Q6P9L4 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp49Q6P9L4 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp49Q6P9L4 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp49Q6P9L4 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp49Q6P9L4 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp49Q6P9L4 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp49Q6P9L4 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp49Q6P9L4 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp49Q6P9L4 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp49Q6P9L4 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp49Q6P9L4 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp49Q6P9L4 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp49Q6P9L4 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp49Q6P9L4 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp49Q6P9L4 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp49Q6P9L4 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp49Q6P9L4 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp49Q6P9L4 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp49Q6P9L4 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp49Q6P9L4 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp49Q6P9L4 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp49Q6P9L4 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp49Q6P9L4 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp49Q6P9L4 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp49Q6P9L4 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp49Q6P9L4 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp49Q6P9L4 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp49Q6P9L4 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp49Q6P9L4 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp49Q6P9L4 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp49Q6P9L4 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp49Q6P9L4 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp49Q6P9L4 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp49Q6P9L4 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp49Q6P9L4 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp49Q6P9L4 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp49Q6P9L4 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Usp49Q6P9L4 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms