Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T0

Atg2a, Autophagy-related protein 2 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 1,914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2aQ6P4T0 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg2aQ6P4T0 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg2aQ6P4T0 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg2aQ6P4T0 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg2aQ6P4T0 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg2aQ6P4T0 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg2aQ6P4T0 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg2aQ6P4T0 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg2aQ6P4T0 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg2aQ6P4T0 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg2aQ6P4T0 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg2aQ6P4T0 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg2aQ6P4T0 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg2aQ6P4T0 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg2aQ6P4T0 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg2aQ6P4T0 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg2aQ6P4T0 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg2aQ6P4T0 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg2aQ6P4T0 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg2aQ6P4T0 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg2aQ6P4T0 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg2aQ6P4T0 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg2aQ6P4T0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg2aQ6P4T0 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg2aQ6P4T0 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg2aQ6P4T0 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg2aQ6P4T0 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg2aQ6P4T0 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg2aQ6P4T0 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg2aQ6P4T0 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg2aQ6P4T0 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg2aQ6P4T0 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg2aQ6P4T0 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg2aQ6P4T0 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg2aQ6P4T0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg2aQ6P4T0 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg2aQ6P4T0 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg2aQ6P4T0 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg2aQ6P4T0 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg2aQ6P4T0 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg2aQ6P4T0 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg2aQ6P4T0 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg2aQ6P4T0 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg2aQ6P4T0 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg2aQ6P4T0 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg2aQ6P4T0 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg2aQ6P4T0 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg2aQ6P4T0 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg2aQ6P4T0 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg2aQ6P4T0 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg2aQ6P4T0 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg2aQ6P4T0 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg2aQ6P4T0 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg2aQ6P4T0 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg2aQ6P4T0 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg2aQ6P4T0 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg2aQ6P4T0 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg2aQ6P4T0 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg2aQ6P4T0 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg2aQ6P4T0 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg2aQ6P4T0 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg2aQ6P4T0 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg2aQ6P4T0 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg2aQ6P4T0 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg2aQ6P4T0 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg2aQ6P4T0 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg2aQ6P4T0 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg2aQ6P4T0 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg2aQ6P4T0 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg2aQ6P4T0 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg2aQ6P4T0 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg2aQ6P4T0 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg2aQ6P4T0 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg2aQ6P4T0 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg2aQ6P4T0 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg2aQ6P4T0 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg2aQ6P4T0 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg2aQ6P4T0 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg2aQ6P4T0 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg2aQ6P4T0 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg2aQ6P4T0 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg2aQ6P4T0 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg2aQ6P4T0 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg2aQ6P4T0 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg2aQ6P4T0 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg2aQ6P4T0 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg2aQ6P4T0 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg2aQ6P4T0 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg2aQ6P4T0 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg2aQ6P4T0 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg2aQ6P4T0 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg2aQ6P4T0 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg2aQ6P4T0 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg2aQ6P4T0 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg2aQ6P4T0 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg2aQ6P4T0 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg2aQ6P4T0 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg2aQ6P4T0 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg2aQ6P4T0 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg2aQ6P4T0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms