Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZQ4

Paxip1, PAX-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,056 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxip1Q6NZQ4 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Paxip1Q6NZQ4 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Paxip1Q6NZQ4 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Paxip1Q6NZQ4 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Paxip1Q6NZQ4 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Paxip1Q6NZQ4 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Paxip1Q6NZQ4 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Paxip1Q6NZQ4 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Paxip1Q6NZQ4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Paxip1Q6NZQ4 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Paxip1Q6NZQ4 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Paxip1Q6NZQ4 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Paxip1Q6NZQ4 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Paxip1Q6NZQ4 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Paxip1Q6NZQ4 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Paxip1Q6NZQ4 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Paxip1Q6NZQ4 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Paxip1Q6NZQ4 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Paxip1Q6NZQ4 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Paxip1Q6NZQ4 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Paxip1Q6NZQ4 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Paxip1Q6NZQ4 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Paxip1Q6NZQ4 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Paxip1Q6NZQ4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Paxip1Q6NZQ4 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Paxip1Q6NZQ4 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Paxip1Q6NZQ4 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Paxip1Q6NZQ4 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Paxip1Q6NZQ4 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Paxip1Q6NZQ4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Paxip1Q6NZQ4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Paxip1Q6NZQ4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Paxip1Q6NZQ4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Paxip1Q6NZQ4 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Paxip1Q6NZQ4 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Paxip1Q6NZQ4 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Paxip1Q6NZQ4 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Paxip1Q6NZQ4 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Paxip1Q6NZQ4 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Paxip1Q6NZQ4 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Paxip1Q6NZQ4 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Paxip1Q6NZQ4 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Paxip1Q6NZQ4 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Paxip1Q6NZQ4 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Paxip1Q6NZQ4 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Paxip1Q6NZQ4 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Paxip1Q6NZQ4 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Paxip1Q6NZQ4 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Paxip1Q6NZQ4 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Paxip1Q6NZQ4 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Paxip1Q6NZQ4 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Paxip1Q6NZQ4 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Paxip1Q6NZQ4 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Paxip1Q6NZQ4 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Paxip1Q6NZQ4 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Paxip1Q6NZQ4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Paxip1Q6NZQ4 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Paxip1Q6NZQ4 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Paxip1Q6NZQ4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Paxip1Q6NZQ4 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Paxip1Q6NZQ4 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Paxip1Q6NZQ4 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Paxip1Q6NZQ4 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Paxip1Q6NZQ4 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Paxip1Q6NZQ4 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Paxip1Q6NZQ4 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Paxip1Q6NZQ4 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Paxip1Q6NZQ4 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Paxip1Q6NZQ4 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Paxip1Q6NZQ4 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Paxip1Q6NZQ4 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Paxip1Q6NZQ4 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Paxip1Q6NZQ4 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Paxip1Q6NZQ4 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Paxip1Q6NZQ4 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Paxip1Q6NZQ4 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Paxip1Q6NZQ4 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Paxip1Q6NZQ4 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Paxip1Q6NZQ4 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Paxip1Q6NZQ4 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Paxip1Q6NZQ4 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Paxip1Q6NZQ4 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Paxip1Q6NZQ4 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Paxip1Q6NZQ4 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Paxip1Q6NZQ4 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Paxip1Q6NZQ4 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Paxip1Q6NZQ4 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Paxip1Q6NZQ4 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Paxip1Q6NZQ4 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Paxip1Q6NZQ4 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Paxip1Q6NZQ4 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Paxip1Q6NZQ4 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Paxip1Q6NZQ4 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Paxip1Q6NZQ4 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Paxip1Q6NZQ4 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Paxip1Q6NZQ4 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Paxip1Q6NZQ4 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Paxip1Q6NZQ4 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Paxip1Q6NZQ4 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Paxip1Q6NZQ4 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms