Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXI6

Rprd2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd2Q6NXI6 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rprd2Q6NXI6 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rprd2Q6NXI6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rprd2Q6NXI6 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Rprd2Q6NXI6 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rprd2Q6NXI6 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rprd2Q6NXI6 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rprd2Q6NXI6 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Rprd2Q6NXI6 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rprd2Q6NXI6 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rprd2Q6NXI6 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rprd2Q6NXI6 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Rprd2Q6NXI6 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Rprd2Q6NXI6 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rprd2Q6NXI6 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rprd2Q6NXI6 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rprd2Q6NXI6 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rprd2Q6NXI6 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rprd2Q6NXI6 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rprd2Q6NXI6 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rprd2Q6NXI6 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rprd2Q6NXI6 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rprd2Q6NXI6 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rprd2Q6NXI6 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rprd2Q6NXI6 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rprd2Q6NXI6 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rprd2Q6NXI6 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Rprd2Q6NXI6 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Rprd2Q6NXI6 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Rprd2Q6NXI6 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Rprd2Q6NXI6 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Rprd2Q6NXI6 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rprd2Q6NXI6 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rprd2Q6NXI6 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rprd2Q6NXI6 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rprd2Q6NXI6 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rprd2Q6NXI6 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Rprd2Q6NXI6 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rprd2Q6NXI6 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rprd2Q6NXI6 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rprd2Q6NXI6 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rprd2Q6NXI6 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rprd2Q6NXI6 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rprd2Q6NXI6 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rprd2Q6NXI6 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rprd2Q6NXI6 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rprd2Q6NXI6 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rprd2Q6NXI6 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rprd2Q6NXI6 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rprd2Q6NXI6 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rprd2Q6NXI6 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rprd2Q6NXI6 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rprd2Q6NXI6 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rprd2Q6NXI6 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rprd2Q6NXI6 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rprd2Q6NXI6 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rprd2Q6NXI6 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rprd2Q6NXI6 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rprd2Q6NXI6 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rprd2Q6NXI6 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rprd2Q6NXI6 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Rprd2Q6NXI6 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rprd2Q6NXI6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rprd2Q6NXI6 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rprd2Q6NXI6 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rprd2Q6NXI6 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rprd2Q6NXI6 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rprd2Q6NXI6 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rprd2Q6NXI6 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Rprd2Q6NXI6 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rprd2Q6NXI6 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rprd2Q6NXI6 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rprd2Q6NXI6 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rprd2Q6NXI6 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rprd2Q6NXI6 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rprd2Q6NXI6 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rprd2Q6NXI6 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rprd2Q6NXI6 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rprd2Q6NXI6 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rprd2Q6NXI6 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Rprd2Q6NXI6 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rprd2Q6NXI6 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rprd2Q6NXI6 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Rprd2Q6NXI6 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rprd2Q6NXI6 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rprd2Q6NXI6 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rprd2Q6NXI6 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rprd2Q6NXI6 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rprd2Q6NXI6 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rprd2Q6NXI6 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rprd2Q6NXI6 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rprd2Q6NXI6 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Rprd2Q6NXI6 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Rprd2Q6NXI6 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Rprd2Q6NXI6 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Rprd2Q6NXI6 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rprd2Q6NXI6 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rprd2Q6NXI6 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rprd2Q6NXI6 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rprd2Q6NXI6 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.8 ms