Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWW9

Fndc3b, Fibronectin type III domain-containing protein 3B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3bQ6NWW9 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Fndc3bQ6NWW9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Fndc3bQ6NWW9 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Fndc3bQ6NWW9 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fndc3bQ6NWW9 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fndc3bQ6NWW9 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fndc3bQ6NWW9 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fndc3bQ6NWW9 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fndc3bQ6NWW9 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fndc3bQ6NWW9 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fndc3bQ6NWW9 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fndc3bQ6NWW9 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fndc3bQ6NWW9 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fndc3bQ6NWW9 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fndc3bQ6NWW9 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fndc3bQ6NWW9 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fndc3bQ6NWW9 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fndc3bQ6NWW9 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fndc3bQ6NWW9 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fndc3bQ6NWW9 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Fndc3bQ6NWW9 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fndc3bQ6NWW9 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fndc3bQ6NWW9 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fndc3bQ6NWW9 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fndc3bQ6NWW9 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fndc3bQ6NWW9 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fndc3bQ6NWW9 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fndc3bQ6NWW9 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fndc3bQ6NWW9 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fndc3bQ6NWW9 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fndc3bQ6NWW9 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Fndc3bQ6NWW9 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fndc3bQ6NWW9 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fndc3bQ6NWW9 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Fndc3bQ6NWW9 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fndc3bQ6NWW9 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fndc3bQ6NWW9 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fndc3bQ6NWW9 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fndc3bQ6NWW9 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fndc3bQ6NWW9 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fndc3bQ6NWW9 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Fndc3bQ6NWW9 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fndc3bQ6NWW9 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fndc3bQ6NWW9 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Fndc3bQ6NWW9 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fndc3bQ6NWW9 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Fndc3bQ6NWW9 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Fndc3bQ6NWW9 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Fndc3bQ6NWW9 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Fndc3bQ6NWW9 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Fndc3bQ6NWW9 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Fndc3bQ6NWW9 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Fndc3bQ6NWW9 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Fndc3bQ6NWW9 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Fndc3bQ6NWW9 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Fndc3bQ6NWW9 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Fndc3bQ6NWW9 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Fndc3bQ6NWW9 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Fndc3bQ6NWW9 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Fndc3bQ6NWW9 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Fndc3bQ6NWW9 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Fndc3bQ6NWW9 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Fndc3bQ6NWW9 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Fndc3bQ6NWW9 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Fndc3bQ6NWW9 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Fndc3bQ6NWW9 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Fndc3bQ6NWW9 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Fndc3bQ6NWW9 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Fndc3bQ6NWW9 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Fndc3bQ6NWW9 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Fndc3bQ6NWW9 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Fndc3bQ6NWW9 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Fndc3bQ6NWW9 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Fndc3bQ6NWW9 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Fndc3bQ6NWW9 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Fndc3bQ6NWW9 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fndc3bQ6NWW9 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fndc3bQ6NWW9 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fndc3bQ6NWW9 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fndc3bQ6NWW9 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fndc3bQ6NWW9 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Fndc3bQ6NWW9 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fndc3bQ6NWW9 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fndc3bQ6NWW9 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fndc3bQ6NWW9 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fndc3bQ6NWW9 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fndc3bQ6NWW9 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fndc3bQ6NWW9 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fndc3bQ6NWW9 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fndc3bQ6NWW9 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fndc3bQ6NWW9 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fndc3bQ6NWW9 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fndc3bQ6NWW9 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fndc3bQ6NWW9 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fndc3bQ6NWW9 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fndc3bQ6NWW9 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Fndc3bQ6NWW9 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fndc3bQ6NWW9 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fndc3bQ6NWW9 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fndc3bQ6NWW9 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms