Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q6DFW0 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q6DFW0 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q6DFW0 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q6DFW0 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q6DFW0 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q6DFW0 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q6DFW0 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q6DFW0 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q6DFW0 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q6DFW0 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q6DFW0 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q6DFW0 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Q6DFW0 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q6DFW0 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q6DFW0 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q6DFW0 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q6DFW0 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q6DFW0 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q6DFW0 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q6DFW0 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q6DFW0 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q6DFW0 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q6DFW0 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q6DFW0 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q6DFW0 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q6DFW0 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q6DFW0 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q6DFW0 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q6DFW0 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q6DFW0 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q6DFW0 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q6DFW0 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q6DFW0 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Q6DFW0 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q6DFW0 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q6DFW0 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q6DFW0 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q6DFW0 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q6DFW0 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q6DFW0 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q6DFW0 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q6DFW0 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q6DFW0 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q6DFW0 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q6DFW0 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q6DFW0 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q6DFW0 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q6DFW0 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q6DFW0 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q6DFW0 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q6DFW0 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q6DFW0 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q6DFW0 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q6DFW0 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q6DFW0 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q6DFW0 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q6DFW0 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q6DFW0 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q6DFW0 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q6DFW0 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q6DFW0 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q6DFW0 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q6DFW0 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q6DFW0 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q6DFW0 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q6DFW0 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q6DFW0 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q6DFW0 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q6DFW0 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q6DFW0 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q6DFW0 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q6DFW0 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q6DFW0 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q6DFW0 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q6DFW0 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q6DFW0 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q6DFW0 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q6DFW0 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q6DFW0 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q6DFW0 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q6DFW0 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q6DFW0 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q6DFW0 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q6DFW0 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q6DFW0 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q6DFW0 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Q6DFW0 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q6DFW0 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Q6DFW0 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Q6DFW0 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q6DFW0 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q6DFW0 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q6DFW0 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q6DFW0 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q6DFW0 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q6DFW0 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q6DFW0 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q6DFW0 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q6DFW0 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms