Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rftn1Q6A0D4 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rftn1Q6A0D4 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rftn1Q6A0D4 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Rftn1Q6A0D4 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rftn1Q6A0D4 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rftn1Q6A0D4 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rftn1Q6A0D4 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rftn1Q6A0D4 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rftn1Q6A0D4 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rftn1Q6A0D4 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rftn1Q6A0D4 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rftn1Q6A0D4 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rftn1Q6A0D4 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rftn1Q6A0D4 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rftn1Q6A0D4 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rftn1Q6A0D4 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rftn1Q6A0D4 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rftn1Q6A0D4 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rftn1Q6A0D4 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rftn1Q6A0D4 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rftn1Q6A0D4 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rftn1Q6A0D4 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rftn1Q6A0D4 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rftn1Q6A0D4 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Rftn1Q6A0D4 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rftn1Q6A0D4 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rftn1Q6A0D4 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rftn1Q6A0D4 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rftn1Q6A0D4 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rftn1Q6A0D4 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Rftn1Q6A0D4 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rftn1Q6A0D4 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rftn1Q6A0D4 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rftn1Q6A0D4 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Rftn1Q6A0D4 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rftn1Q6A0D4 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rftn1Q6A0D4 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rftn1Q6A0D4 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rftn1Q6A0D4 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rftn1Q6A0D4 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rftn1Q6A0D4 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rftn1Q6A0D4 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rftn1Q6A0D4 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rftn1Q6A0D4 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rftn1Q6A0D4 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rftn1Q6A0D4 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rftn1Q6A0D4 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rftn1Q6A0D4 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Rftn1Q6A0D4 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rftn1Q6A0D4 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rftn1Q6A0D4 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Rftn1Q6A0D4 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rftn1Q6A0D4 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rftn1Q6A0D4 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rftn1Q6A0D4 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rftn1Q6A0D4 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rftn1Q6A0D4 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rftn1Q6A0D4 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rftn1Q6A0D4 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rftn1Q6A0D4 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rftn1Q6A0D4 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rftn1Q6A0D4 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rftn1Q6A0D4 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rftn1Q6A0D4 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rftn1Q6A0D4 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rftn1Q6A0D4 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rftn1Q6A0D4 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Rftn1Q6A0D4 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rftn1Q6A0D4 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rftn1Q6A0D4 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rftn1Q6A0D4 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rftn1Q6A0D4 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rftn1Q6A0D4 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rftn1Q6A0D4 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rftn1Q6A0D4 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rftn1Q6A0D4 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rftn1Q6A0D4 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rftn1Q6A0D4 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rftn1Q6A0D4 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rftn1Q6A0D4 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rftn1Q6A0D4 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rftn1Q6A0D4 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Rftn1Q6A0D4 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Rftn1Q6A0D4 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rftn1Q6A0D4 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rftn1Q6A0D4 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rftn1Q6A0D4 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rftn1Q6A0D4 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rftn1Q6A0D4 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rftn1Q6A0D4 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rftn1Q6A0D4 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rftn1Q6A0D4 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rftn1Q6A0D4 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rftn1Q6A0D4 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rftn1Q6A0D4 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rftn1Q6A0D4 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rftn1Q6A0D4 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rftn1Q6A0D4 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rftn1Q6A0D4 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms