Protein–RNA interactions for Protein: Q66X22

Nlrp9b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp9bQ66X22 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Nlrp9bQ66X22 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Nlrp9bQ66X22 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nlrp9bQ66X22 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nlrp9bQ66X22 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nlrp9bQ66X22 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nlrp9bQ66X22 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Nlrp9bQ66X22 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nlrp9bQ66X22 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Nlrp9bQ66X22 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nlrp9bQ66X22 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Nlrp9bQ66X22 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nlrp9bQ66X22 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nlrp9bQ66X22 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nlrp9bQ66X22 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nlrp9bQ66X22 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nlrp9bQ66X22 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nlrp9bQ66X22 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Nlrp9bQ66X22 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nlrp9bQ66X22 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Nlrp9bQ66X22 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nlrp9bQ66X22 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nlrp9bQ66X22 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nlrp9bQ66X22 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nlrp9bQ66X22 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nlrp9bQ66X22 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nlrp9bQ66X22 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nlrp9bQ66X22 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Nlrp9bQ66X22 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Nlrp9bQ66X22 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nlrp9bQ66X22 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nlrp9bQ66X22 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nlrp9bQ66X22 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nlrp9bQ66X22 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nlrp9bQ66X22 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nlrp9bQ66X22 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nlrp9bQ66X22 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nlrp9bQ66X22 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nlrp9bQ66X22 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nlrp9bQ66X22 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nlrp9bQ66X22 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nlrp9bQ66X22 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Nlrp9bQ66X22 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nlrp9bQ66X22 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nlrp9bQ66X22 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nlrp9bQ66X22 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nlrp9bQ66X22 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nlrp9bQ66X22 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nlrp9bQ66X22 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nlrp9bQ66X22 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nlrp9bQ66X22 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nlrp9bQ66X22 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nlrp9bQ66X22 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nlrp9bQ66X22 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nlrp9bQ66X22 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nlrp9bQ66X22 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nlrp9bQ66X22 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nlrp9bQ66X22 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nlrp9bQ66X22 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nlrp9bQ66X22 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nlrp9bQ66X22 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nlrp9bQ66X22 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nlrp9bQ66X22 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nlrp9bQ66X22 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nlrp9bQ66X22 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nlrp9bQ66X22 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nlrp9bQ66X22 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nlrp9bQ66X22 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nlrp9bQ66X22 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Nlrp9bQ66X22 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nlrp9bQ66X22 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nlrp9bQ66X22 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Nlrp9bQ66X22 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nlrp9bQ66X22 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nlrp9bQ66X22 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Nlrp9bQ66X22 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nlrp9bQ66X22 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nlrp9bQ66X22 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nlrp9bQ66X22 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nlrp9bQ66X22 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nlrp9bQ66X22 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nlrp9bQ66X22 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nlrp9bQ66X22 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nlrp9bQ66X22 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Nlrp9bQ66X22 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nlrp9bQ66X22 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nlrp9bQ66X22 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nlrp9bQ66X22 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nlrp9bQ66X22 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nlrp9bQ66X22 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nlrp9bQ66X22 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Nlrp9bQ66X22 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nlrp9bQ66X22 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nlrp9bQ66X22 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nlrp9bQ66X22 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nlrp9bQ66X22 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Nlrp9bQ66X22 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nlrp9bQ66X22 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nlrp9bQ66X22 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nlrp9bQ66X22 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms