Protein–RNA interactions for Protein: Q66X05

Nlrp4f, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4F, mousemouse

Predictions only

Length 959 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4fQ66X05 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrp4fQ66X05 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrp4fQ66X05 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrp4fQ66X05 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrp4fQ66X05 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrp4fQ66X05 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrp4fQ66X05 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrp4fQ66X05 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrp4fQ66X05 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrp4fQ66X05 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrp4fQ66X05 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrp4fQ66X05 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrp4fQ66X05 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrp4fQ66X05 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrp4fQ66X05 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrp4fQ66X05 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrp4fQ66X05 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrp4fQ66X05 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrp4fQ66X05 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrp4fQ66X05 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrp4fQ66X05 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrp4fQ66X05 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrp4fQ66X05 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrp4fQ66X05 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrp4fQ66X05 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrp4fQ66X05 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrp4fQ66X05 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrp4fQ66X05 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrp4fQ66X05 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrp4fQ66X05 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrp4fQ66X05 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrp4fQ66X05 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrp4fQ66X05 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrp4fQ66X05 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrp4fQ66X05 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nlrp4fQ66X05 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nlrp4fQ66X05 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nlrp4fQ66X05 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nlrp4fQ66X05 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nlrp4fQ66X05 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nlrp4fQ66X05 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nlrp4fQ66X05 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nlrp4fQ66X05 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nlrp4fQ66X05 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nlrp4fQ66X05 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nlrp4fQ66X05 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nlrp4fQ66X05 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nlrp4fQ66X05 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nlrp4fQ66X05 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nlrp4fQ66X05 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nlrp4fQ66X05 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Nlrp4fQ66X05 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nlrp4fQ66X05 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nlrp4fQ66X05 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nlrp4fQ66X05 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Nlrp4fQ66X05 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nlrp4fQ66X05 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nlrp4fQ66X05 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nlrp4fQ66X05 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nlrp4fQ66X05 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrp4fQ66X05 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrp4fQ66X05 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrp4fQ66X05 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrp4fQ66X05 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrp4fQ66X05 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrp4fQ66X05 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrp4fQ66X05 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrp4fQ66X05 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrp4fQ66X05 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrp4fQ66X05 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrp4fQ66X05 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrp4fQ66X05 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrp4fQ66X05 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrp4fQ66X05 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrp4fQ66X05 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrp4fQ66X05 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrp4fQ66X05 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrp4fQ66X05 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrp4fQ66X05 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrp4fQ66X05 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrp4fQ66X05 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nlrp4fQ66X05 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nlrp4fQ66X05 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nlrp4fQ66X05 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nlrp4fQ66X05 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nlrp4fQ66X05 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nlrp4fQ66X05 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nlrp4fQ66X05 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nlrp4fQ66X05 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nlrp4fQ66X05 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nlrp4fQ66X05 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nlrp4fQ66X05 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nlrp4fQ66X05 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nlrp4fQ66X05 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nlrp4fQ66X05 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nlrp4fQ66X05 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nlrp4fQ66X05 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nlrp4fQ66X05 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nlrp4fQ66X05 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nlrp4fQ66X05 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms