Protein–RNA interactions for Protein: Q64310

Surf4, Surfeit locus protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf4Q64310 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Surf4Q64310 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Surf4Q64310 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Surf4Q64310 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Surf4Q64310 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Surf4Q64310 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Surf4Q64310 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Surf4Q64310 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Surf4Q64310 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Surf4Q64310 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Surf4Q64310 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Surf4Q64310 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Surf4Q64310 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Surf4Q64310 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Surf4Q64310 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Surf4Q64310 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Surf4Q64310 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Surf4Q64310 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Surf4Q64310 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Surf4Q64310 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Surf4Q64310 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Surf4Q64310 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Surf4Q64310 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Surf4Q64310 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Surf4Q64310 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Surf4Q64310 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Surf4Q64310 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Surf4Q64310 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Surf4Q64310 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Surf4Q64310 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Surf4Q64310 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Surf4Q64310 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Surf4Q64310 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Surf4Q64310 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Surf4Q64310 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Surf4Q64310 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Surf4Q64310 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Surf4Q64310 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Surf4Q64310 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Surf4Q64310 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Surf4Q64310 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Surf4Q64310 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Surf4Q64310 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Surf4Q64310 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Surf4Q64310 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Surf4Q64310 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Surf4Q64310 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Surf4Q64310 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Surf4Q64310 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Surf4Q64310 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Surf4Q64310 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Surf4Q64310 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Surf4Q64310 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Surf4Q64310 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Surf4Q64310 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Surf4Q64310 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Surf4Q64310 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Surf4Q64310 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Surf4Q64310 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Surf4Q64310 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Surf4Q64310 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Surf4Q64310 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Surf4Q64310 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Surf4Q64310 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Surf4Q64310 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Surf4Q64310 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Surf4Q64310 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Surf4Q64310 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Surf4Q64310 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Surf4Q64310 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Surf4Q64310 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Surf4Q64310 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Surf4Q64310 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Surf4Q64310 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Surf4Q64310 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Surf4Q64310 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Surf4Q64310 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Surf4Q64310 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Surf4Q64310 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Surf4Q64310 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Surf4Q64310 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Surf4Q64310 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Surf4Q64310 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Surf4Q64310 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Surf4Q64310 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Surf4Q64310 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Surf4Q64310 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Surf4Q64310 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Surf4Q64310 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Surf4Q64310 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Surf4Q64310 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Surf4Q64310 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Surf4Q64310 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Surf4Q64310 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Surf4Q64310 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Surf4Q64310 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Surf4Q64310 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Surf4Q64310 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Surf4Q64310 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Surf4Q64310 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms