Protein–RNA interactions for Protein: Q64287

Irf4, Interferon regulatory factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf4Q64287 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irf4Q64287 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irf4Q64287 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irf4Q64287 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irf4Q64287 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irf4Q64287 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irf4Q64287 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irf4Q64287 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Irf4Q64287 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irf4Q64287 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irf4Q64287 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irf4Q64287 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irf4Q64287 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Irf4Q64287 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irf4Q64287 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irf4Q64287 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irf4Q64287 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irf4Q64287 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irf4Q64287 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irf4Q64287 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irf4Q64287 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irf4Q64287 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irf4Q64287 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irf4Q64287 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irf4Q64287 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irf4Q64287 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irf4Q64287 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irf4Q64287 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irf4Q64287 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irf4Q64287 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irf4Q64287 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irf4Q64287 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irf4Q64287 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irf4Q64287 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irf4Q64287 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irf4Q64287 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irf4Q64287 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Irf4Q64287 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irf4Q64287 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irf4Q64287 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irf4Q64287 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irf4Q64287 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irf4Q64287 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irf4Q64287 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Irf4Q64287 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irf4Q64287 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irf4Q64287 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irf4Q64287 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irf4Q64287 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irf4Q64287 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irf4Q64287 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irf4Q64287 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irf4Q64287 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irf4Q64287 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irf4Q64287 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irf4Q64287 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irf4Q64287 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irf4Q64287 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irf4Q64287 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irf4Q64287 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irf4Q64287 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irf4Q64287 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irf4Q64287 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Irf4Q64287 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irf4Q64287 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irf4Q64287 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irf4Q64287 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irf4Q64287 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irf4Q64287 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irf4Q64287 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irf4Q64287 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irf4Q64287 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irf4Q64287 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irf4Q64287 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irf4Q64287 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irf4Q64287 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irf4Q64287 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irf4Q64287 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irf4Q64287 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irf4Q64287 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irf4Q64287 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irf4Q64287 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irf4Q64287 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irf4Q64287 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irf4Q64287 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irf4Q64287 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irf4Q64287 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irf4Q64287 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irf4Q64287 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irf4Q64287 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irf4Q64287 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irf4Q64287 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irf4Q64287 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irf4Q64287 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irf4Q64287 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irf4Q64287 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irf4Q64287 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irf4Q64287 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irf4Q64287 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irf4Q64287 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms