Protein–RNA interactions for Protein: Q63955

Pou4f3, POU domain, class 4, transcription factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f3Q63955 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pou4f3Q63955 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pou4f3Q63955 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pou4f3Q63955 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pou4f3Q63955 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pou4f3Q63955 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pou4f3Q63955 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pou4f3Q63955 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pou4f3Q63955 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pou4f3Q63955 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pou4f3Q63955 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pou4f3Q63955 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pou4f3Q63955 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pou4f3Q63955 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pou4f3Q63955 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pou4f3Q63955 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pou4f3Q63955 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pou4f3Q63955 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pou4f3Q63955 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pou4f3Q63955 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pou4f3Q63955 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pou4f3Q63955 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pou4f3Q63955 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pou4f3Q63955 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pou4f3Q63955 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pou4f3Q63955 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pou4f3Q63955 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pou4f3Q63955 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pou4f3Q63955 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pou4f3Q63955 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pou4f3Q63955 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pou4f3Q63955 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pou4f3Q63955 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pou4f3Q63955 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pou4f3Q63955 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pou4f3Q63955 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pou4f3Q63955 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pou4f3Q63955 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pou4f3Q63955 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pou4f3Q63955 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pou4f3Q63955 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pou4f3Q63955 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pou4f3Q63955 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pou4f3Q63955 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pou4f3Q63955 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pou4f3Q63955 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pou4f3Q63955 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pou4f3Q63955 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pou4f3Q63955 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pou4f3Q63955 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pou4f3Q63955 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pou4f3Q63955 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pou4f3Q63955 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pou4f3Q63955 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pou4f3Q63955 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pou4f3Q63955 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pou4f3Q63955 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pou4f3Q63955 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pou4f3Q63955 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pou4f3Q63955 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pou4f3Q63955 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pou4f3Q63955 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pou4f3Q63955 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pou4f3Q63955 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pou4f3Q63955 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pou4f3Q63955 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pou4f3Q63955 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pou4f3Q63955 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pou4f3Q63955 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pou4f3Q63955 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pou4f3Q63955 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pou4f3Q63955 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pou4f3Q63955 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pou4f3Q63955 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pou4f3Q63955 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pou4f3Q63955 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pou4f3Q63955 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Pou4f3Q63955 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Pou4f3Q63955 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pou4f3Q63955 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pou4f3Q63955 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pou4f3Q63955 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pou4f3Q63955 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pou4f3Q63955 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pou4f3Q63955 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pou4f3Q63955 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pou4f3Q63955 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pou4f3Q63955 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pou4f3Q63955 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pou4f3Q63955 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Pou4f3Q63955 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pou4f3Q63955 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pou4f3Q63955 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pou4f3Q63955 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pou4f3Q63955 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pou4f3Q63955 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pou4f3Q63955 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pou4f3Q63955 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pou4f3Q63955 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pou4f3Q63955 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms