Protein–RNA interactions for Protein: Q62507

Coch, Cochlin, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CochQ62507 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CochQ62507 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CochQ62507 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CochQ62507 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CochQ62507 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CochQ62507 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CochQ62507 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CochQ62507 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CochQ62507 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CochQ62507 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CochQ62507 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CochQ62507 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CochQ62507 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CochQ62507 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CochQ62507 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CochQ62507 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CochQ62507 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CochQ62507 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CochQ62507 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CochQ62507 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CochQ62507 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CochQ62507 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CochQ62507 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CochQ62507 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CochQ62507 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CochQ62507 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CochQ62507 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CochQ62507 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CochQ62507 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CochQ62507 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CochQ62507 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CochQ62507 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CochQ62507 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CochQ62507 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CochQ62507 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CochQ62507 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CochQ62507 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CochQ62507 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CochQ62507 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CochQ62507 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CochQ62507 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CochQ62507 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CochQ62507 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CochQ62507 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CochQ62507 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CochQ62507 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CochQ62507 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CochQ62507 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CochQ62507 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CochQ62507 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CochQ62507 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CochQ62507 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CochQ62507 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CochQ62507 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CochQ62507 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CochQ62507 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CochQ62507 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CochQ62507 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CochQ62507 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CochQ62507 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CochQ62507 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CochQ62507 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CochQ62507 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CochQ62507 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CochQ62507 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CochQ62507 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CochQ62507 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CochQ62507 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CochQ62507 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CochQ62507 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CochQ62507 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CochQ62507 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CochQ62507 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CochQ62507 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CochQ62507 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CochQ62507 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CochQ62507 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CochQ62507 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CochQ62507 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CochQ62507 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CochQ62507 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CochQ62507 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CochQ62507 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CochQ62507 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CochQ62507 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CochQ62507 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CochQ62507 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CochQ62507 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CochQ62507 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CochQ62507 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CochQ62507 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CochQ62507 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CochQ62507 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CochQ62507 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CochQ62507 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CochQ62507 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CochQ62507 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CochQ62507 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CochQ62507 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CochQ62507 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms