Protein–RNA interactions for Protein: Q62458

Gm20809, (clone BALB14N), mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20809Q62458 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20809Q62458 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20809Q62458 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20809Q62458 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm20809Q62458 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm20809Q62458 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20809Q62458 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20809Q62458 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20809Q62458 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20809Q62458 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20809Q62458 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20809Q62458 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20809Q62458 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20809Q62458 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20809Q62458 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20809Q62458 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20809Q62458 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20809Q62458 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20809Q62458 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20809Q62458 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20809Q62458 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20809Q62458 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20809Q62458 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20809Q62458 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20809Q62458 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20809Q62458 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20809Q62458 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20809Q62458 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20809Q62458 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20809Q62458 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20809Q62458 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20809Q62458 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20809Q62458 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20809Q62458 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20809Q62458 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20809Q62458 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20809Q62458 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Gm20809Q62458 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20809Q62458 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Gm20809Q62458 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20809Q62458 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20809Q62458 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20809Q62458 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20809Q62458 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Gm20809Q62458 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Gm20809Q62458 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Gm20809Q62458 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm20809Q62458 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm20809Q62458 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm20809Q62458 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm20809Q62458 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm20809Q62458 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm20809Q62458 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm20809Q62458 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm20809Q62458 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm20809Q62458 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm20809Q62458 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm20809Q62458 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm20809Q62458 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm20809Q62458 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm20809Q62458 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm20809Q62458 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm20809Q62458 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm20809Q62458 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm20809Q62458 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm20809Q62458 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm20809Q62458 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm20809Q62458 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm20809Q62458 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm20809Q62458 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm20809Q62458 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm20809Q62458 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm20809Q62458 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm20809Q62458 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm20809Q62458 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20809Q62458 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20809Q62458 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20809Q62458 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20809Q62458 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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