Protein–RNA interactions for Protein: Q62252

Spa17, Sperm surface protein Sp17, mousemouse

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spa17Q62252 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spa17Q62252 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spa17Q62252 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spa17Q62252 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spa17Q62252 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spa17Q62252 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spa17Q62252 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spa17Q62252 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spa17Q62252 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spa17Q62252 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spa17Q62252 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spa17Q62252 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Spa17Q62252 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spa17Q62252 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spa17Q62252 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spa17Q62252 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spa17Q62252 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spa17Q62252 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spa17Q62252 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Spa17Q62252 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Spa17Q62252 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spa17Q62252 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spa17Q62252 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spa17Q62252 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spa17Q62252 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spa17Q62252 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spa17Q62252 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spa17Q62252 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spa17Q62252 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spa17Q62252 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spa17Q62252 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spa17Q62252 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spa17Q62252 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spa17Q62252 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spa17Q62252 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spa17Q62252 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spa17Q62252 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spa17Q62252 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spa17Q62252 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spa17Q62252 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spa17Q62252 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spa17Q62252 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spa17Q62252 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spa17Q62252 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spa17Q62252 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spa17Q62252 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spa17Q62252 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spa17Q62252 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spa17Q62252 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spa17Q62252 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spa17Q62252 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spa17Q62252 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spa17Q62252 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spa17Q62252 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spa17Q62252 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spa17Q62252 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spa17Q62252 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spa17Q62252 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spa17Q62252 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spa17Q62252 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spa17Q62252 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spa17Q62252 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spa17Q62252 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spa17Q62252 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spa17Q62252 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spa17Q62252 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spa17Q62252 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spa17Q62252 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spa17Q62252 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Spa17Q62252 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Spa17Q62252 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Spa17Q62252 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Spa17Q62252 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Spa17Q62252 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Spa17Q62252 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Spa17Q62252 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Spa17Q62252 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Spa17Q62252 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Spa17Q62252 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spa17Q62252 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spa17Q62252 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spa17Q62252 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spa17Q62252 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spa17Q62252 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spa17Q62252 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Spa17Q62252 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spa17Q62252 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spa17Q62252 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spa17Q62252 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spa17Q62252 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spa17Q62252 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spa17Q62252 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spa17Q62252 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spa17Q62252 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spa17Q62252 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spa17Q62252 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spa17Q62252 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spa17Q62252 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spa17Q62252 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spa17Q62252 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms