Protein–RNA interactions for Protein: Q62035

Ptafr, Platelet-activating factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtafrQ62035 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtafrQ62035 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtafrQ62035 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtafrQ62035 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtafrQ62035 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtafrQ62035 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtafrQ62035 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtafrQ62035 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtafrQ62035 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PtafrQ62035 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtafrQ62035 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PtafrQ62035 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtafrQ62035 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtafrQ62035 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtafrQ62035 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtafrQ62035 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtafrQ62035 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtafrQ62035 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtafrQ62035 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtafrQ62035 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtafrQ62035 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtafrQ62035 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtafrQ62035 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtafrQ62035 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtafrQ62035 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtafrQ62035 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtafrQ62035 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtafrQ62035 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtafrQ62035 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtafrQ62035 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtafrQ62035 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtafrQ62035 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtafrQ62035 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtafrQ62035 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtafrQ62035 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtafrQ62035 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtafrQ62035 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtafrQ62035 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtafrQ62035 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtafrQ62035 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtafrQ62035 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtafrQ62035 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtafrQ62035 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PtafrQ62035 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PtafrQ62035 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PtafrQ62035 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PtafrQ62035 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PtafrQ62035 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PtafrQ62035 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PtafrQ62035 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PtafrQ62035 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PtafrQ62035 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PtafrQ62035 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PtafrQ62035 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PtafrQ62035 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PtafrQ62035 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PtafrQ62035 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PtafrQ62035 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PtafrQ62035 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PtafrQ62035 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PtafrQ62035 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PtafrQ62035 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PtafrQ62035 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PtafrQ62035 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PtafrQ62035 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PtafrQ62035 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PtafrQ62035 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtafrQ62035 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtafrQ62035 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtafrQ62035 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtafrQ62035 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtafrQ62035 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtafrQ62035 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PtafrQ62035 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtafrQ62035 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtafrQ62035 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PtafrQ62035 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtafrQ62035 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtafrQ62035 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PtafrQ62035 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtafrQ62035 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtafrQ62035 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtafrQ62035 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtafrQ62035 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtafrQ62035 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtafrQ62035 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtafrQ62035 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtafrQ62035 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtafrQ62035 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtafrQ62035 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtafrQ62035 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtafrQ62035 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtafrQ62035 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtafrQ62035 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtafrQ62035 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtafrQ62035 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtafrQ62035 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtafrQ62035 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtafrQ62035 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtafrQ62035 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms