Protein–RNA interactions for Protein: Q61466

Smarcd1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcd1Q61466 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smarcd1Q61466 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smarcd1Q61466 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smarcd1Q61466 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smarcd1Q61466 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smarcd1Q61466 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smarcd1Q61466 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smarcd1Q61466 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Smarcd1Q61466 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Smarcd1Q61466 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Smarcd1Q61466 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smarcd1Q61466 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smarcd1Q61466 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smarcd1Q61466 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smarcd1Q61466 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smarcd1Q61466 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smarcd1Q61466 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smarcd1Q61466 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smarcd1Q61466 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smarcd1Q61466 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smarcd1Q61466 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smarcd1Q61466 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smarcd1Q61466 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Smarcd1Q61466 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smarcd1Q61466 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smarcd1Q61466 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smarcd1Q61466 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smarcd1Q61466 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smarcd1Q61466 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smarcd1Q61466 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smarcd1Q61466 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smarcd1Q61466 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smarcd1Q61466 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smarcd1Q61466 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smarcd1Q61466 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smarcd1Q61466 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smarcd1Q61466 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smarcd1Q61466 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smarcd1Q61466 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smarcd1Q61466 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smarcd1Q61466 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smarcd1Q61466 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smarcd1Q61466 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smarcd1Q61466 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smarcd1Q61466 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smarcd1Q61466 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Smarcd1Q61466 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smarcd1Q61466 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smarcd1Q61466 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smarcd1Q61466 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smarcd1Q61466 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smarcd1Q61466 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smarcd1Q61466 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smarcd1Q61466 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smarcd1Q61466 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smarcd1Q61466 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Smarcd1Q61466 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Smarcd1Q61466 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smarcd1Q61466 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smarcd1Q61466 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smarcd1Q61466 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smarcd1Q61466 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Smarcd1Q61466 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Smarcd1Q61466 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smarcd1Q61466 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smarcd1Q61466 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smarcd1Q61466 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smarcd1Q61466 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smarcd1Q61466 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smarcd1Q61466 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smarcd1Q61466 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smarcd1Q61466 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smarcd1Q61466 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smarcd1Q61466 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smarcd1Q61466 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smarcd1Q61466 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smarcd1Q61466 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smarcd1Q61466 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smarcd1Q61466 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smarcd1Q61466 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smarcd1Q61466 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Smarcd1Q61466 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smarcd1Q61466 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smarcd1Q61466 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smarcd1Q61466 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smarcd1Q61466 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smarcd1Q61466 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smarcd1Q61466 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smarcd1Q61466 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smarcd1Q61466 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smarcd1Q61466 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smarcd1Q61466 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smarcd1Q61466 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smarcd1Q61466 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Smarcd1Q61466 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Smarcd1Q61466 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smarcd1Q61466 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smarcd1Q61466 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smarcd1Q61466 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smarcd1Q61466 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms