Protein–RNA interactions for Protein: Q61069

Usf1, Upstream stimulatory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf1Q61069 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usf1Q61069 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usf1Q61069 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usf1Q61069 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usf1Q61069 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usf1Q61069 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usf1Q61069 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usf1Q61069 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usf1Q61069 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usf1Q61069 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usf1Q61069 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usf1Q61069 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Usf1Q61069 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Usf1Q61069 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usf1Q61069 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Usf1Q61069 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usf1Q61069 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usf1Q61069 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Usf1Q61069 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Usf1Q61069 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Usf1Q61069 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Usf1Q61069 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Usf1Q61069 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usf1Q61069 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usf1Q61069 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usf1Q61069 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usf1Q61069 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usf1Q61069 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usf1Q61069 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Usf1Q61069 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usf1Q61069 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Usf1Q61069 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usf1Q61069 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usf1Q61069 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Usf1Q61069 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usf1Q61069 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Usf1Q61069 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms