Protein–RNA interactions for Protein: Q61009

Scarb1, Scavenger receptor class B member 1, mousemouse

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb1Q61009 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Scarb1Q61009 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scarb1Q61009 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Scarb1Q61009 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scarb1Q61009 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Scarb1Q61009 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scarb1Q61009 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scarb1Q61009 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scarb1Q61009 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scarb1Q61009 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scarb1Q61009 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scarb1Q61009 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Scarb1Q61009 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Scarb1Q61009 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Scarb1Q61009 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scarb1Q61009 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scarb1Q61009 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Scarb1Q61009 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Scarb1Q61009 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Scarb1Q61009 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Scarb1Q61009 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scarb1Q61009 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scarb1Q61009 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scarb1Q61009 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Scarb1Q61009 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scarb1Q61009 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scarb1Q61009 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scarb1Q61009 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scarb1Q61009 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scarb1Q61009 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scarb1Q61009 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Scarb1Q61009 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scarb1Q61009 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scarb1Q61009 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scarb1Q61009 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scarb1Q61009 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scarb1Q61009 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Scarb1Q61009 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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