Protein–RNA interactions for Protein: Q60954

Meis1, Homeobox protein Meis1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Meis1Q60954 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Meis1Q60954 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Meis1Q60954 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Meis1Q60954 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Meis1Q60954 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Meis1Q60954 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Meis1Q60954 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Meis1Q60954 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Meis1Q60954 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Meis1Q60954 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Meis1Q60954 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Meis1Q60954 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Meis1Q60954 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Meis1Q60954 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Meis1Q60954 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Meis1Q60954 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Meis1Q60954 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Meis1Q60954 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Meis1Q60954 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Meis1Q60954 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Meis1Q60954 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Meis1Q60954 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Meis1Q60954 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Meis1Q60954 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Meis1Q60954 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Meis1Q60954 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Meis1Q60954 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Meis1Q60954 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Meis1Q60954 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Meis1Q60954 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Meis1Q60954 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Meis1Q60954 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Meis1Q60954 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Meis1Q60954 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Meis1Q60954 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Meis1Q60954 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Meis1Q60954 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Meis1Q60954 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Meis1Q60954 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Meis1Q60954 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Meis1Q60954 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Meis1Q60954 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Meis1Q60954 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Meis1Q60954 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Meis1Q60954 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Meis1Q60954 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Meis1Q60954 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Meis1Q60954 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Meis1Q60954 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Meis1Q60954 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Meis1Q60954 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Meis1Q60954 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Meis1Q60954 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Meis1Q60954 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Meis1Q60954 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Meis1Q60954 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Meis1Q60954 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Meis1Q60954 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Meis1Q60954 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Meis1Q60954 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Meis1Q60954 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Meis1Q60954 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Meis1Q60954 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Meis1Q60954 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Meis1Q60954 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Meis1Q60954 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Meis1Q60954 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Meis1Q60954 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Meis1Q60954 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Meis1Q60954 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Meis1Q60954 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Meis1Q60954 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Meis1Q60954 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Meis1Q60954 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Meis1Q60954 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Meis1Q60954 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Meis1Q60954 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Meis1Q60954 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Meis1Q60954 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Meis1Q60954 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Meis1Q60954 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Meis1Q60954 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Meis1Q60954 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Meis1Q60954 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Meis1Q60954 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Meis1Q60954 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Meis1Q60954 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Meis1Q60954 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Meis1Q60954 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Meis1Q60954 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Meis1Q60954 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Meis1Q60954 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Meis1Q60954 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Meis1Q60954 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Meis1Q60954 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Meis1Q60954 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Meis1Q60954 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Meis1Q60954 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Meis1Q60954 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Meis1Q60954 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms