Protein–RNA interactions for Protein: Q60925

Dbp, D site-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DbpQ60925 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
DbpQ60925 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DbpQ60925 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DbpQ60925 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DbpQ60925 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DbpQ60925 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DbpQ60925 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DbpQ60925 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DbpQ60925 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DbpQ60925 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DbpQ60925 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DbpQ60925 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DbpQ60925 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DbpQ60925 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DbpQ60925 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DbpQ60925 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DbpQ60925 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DbpQ60925 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DbpQ60925 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DbpQ60925 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DbpQ60925 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
DbpQ60925 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DbpQ60925 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DbpQ60925 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DbpQ60925 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DbpQ60925 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DbpQ60925 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DbpQ60925 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DbpQ60925 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DbpQ60925 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DbpQ60925 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DbpQ60925 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DbpQ60925 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DbpQ60925 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DbpQ60925 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DbpQ60925 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DbpQ60925 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms